应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » PCR相关 » 关于qRT-PCR引物的设计
北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
141/2返回列表12下一页
查看: 3490  |  回复: 13
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

zfy535251

新虫 (小有名气)

[求助] 关于qRT-PCR引物的设计 已有2人参与

各位师兄师姐，我现在想要设计qRT-PCR引物，说是引物最好要跨两个外显子，那么问题来了，该怎么预测一段序列的外显子及内含子呢？查了一天都没查到合适黄瓜预测的网站，各位有知道的么

发自小木虫Android客户端
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

虫友问答-分子生物

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2016-04-07 16:35:23
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

stone2239

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
softberry上的FGENESH工具可以预测真核生物基因组序列中的外显子、内含子。http://linux1.softberry.com/berr ... ;amp;subgroup=gfind
赞一下 回复此楼
2楼2016-04-07 18:54:23
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

stone2239

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

参考基因组选择cucumis melo
赞一下 回复此楼
3楼2016-04-07 18:57:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zfy535251

新虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by stone2239 at 2016-04-07 18:57:14
参考基因组选择cucumis melo

嗯嗯，谢谢，下课我试一下，不过有人说也可以看ncbi里的CDS信息，这个可以吗

发自小木虫Android客户端
赞一下 回复此楼
4楼2016-04-08 08:13:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

stone2239

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
4楼: Originally posted by zfy535251 at 2016-04-08 08:13:16
嗯嗯，谢谢，下课我试一下，不过有人说也可以看ncbi里的CDS信息，这个可以吗
...

查到CDS序列信息，再借助软件或在线工具将其与基因组序列比较也可以区分出外显子和内含子区域，但不如我给你的这个好用。
赞一下 回复此楼
5楼2016-04-08 15:35:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zfy535251

新虫 (小有名气)
好的好的，谢谢

发自小木虫Android客户端
回复此楼
6楼2016-04-08 23:40:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gnot_nail

金虫 (正式写手)
分别下载基因的cds序列cdna序列…然后在根据cds设计引物，这时会有一个产物大小，然后你在把你的引物在cdna序列里查找 就能知道在cdna里的片段大小，只要cdna里的大小大于在cds里的片段长度，就跨了…一个vector nti就能搞定

发自小木虫IOS客户端
赞一下 回复此楼
7楼2016-04-09 16:09:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zfy535251

新虫 (小有名气)
引用回帖:
7楼: Originally posted by gnot_nail at 2016-04-09 16:09:02
分别下载基因的cds序列cdna序列…然后在根据cds设计引物，这时会有一个产物大小，然后你在把你的引物在cdna序列里查找 就能知道在cdna里的片段大小，只要cdna里的大小大于在cds里的片段长度，就跨了…一个vector nt ...

cds序列应该就是ncbi里直接查出来的序列吧，cdna序列要在哪里下载呢

发自小木虫Android客户端
赞一下 回复此楼
8楼2016-04-09 18:34:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gnot_nail

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
引用回帖:
8楼: Originally posted by zfy535251 at 2016-04-09 18:34:15
cds序列应该就是ncbi里直接查出来的序列吧，cdna序列要在哪里下载呢
...

ncbi上应该也有……看你研究啥物种 有的物种有自己专门的数据网站

发自小木虫IOS客户端
赞一下 回复此楼
9楼2016-04-09 19:00:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

_晚客

银虫 (小有名气)
根据你的序列设计就好了，注意产物前段与其他基因同源性不要太高就可以了

发自小木虫Android客户端
赞一下 回复此楼
10楼2016-04-09 19:05:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 zfy535251 的主题更新
141/2返回列表12下一页
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 275求调剂 +10 Micky11223 2026-03-25 13/650 2026-03-27 22:42 by Micky11223
[考研] 277跪求调剂 +5 1915668 2026-03-27 8/400 2026-03-27 19:53 by WYUMater
[考研] 328求调剂 +6 嗯滴的基本都 2026-03-27 6/300 2026-03-27 16:49 by sanrepian
[考研] 283求调剂（080500） +4 A child 2026-03-27 4/200 2026-03-27 15:34 by XPU李庆
[考研] 308求调剂 +6 墨墨漠 2026-03-27 6/300 2026-03-27 15:20 by caszguilin
[考研] 085600材料与化工调剂 +10 A-哆啦Z梦 2026-03-23 16/800 2026-03-27 15:13 by caszguilin
[考研] 复试调剂，一志愿南农083200食品科学与工程 +5 XQTJZ 2026-03-26 5/250 2026-03-27 14:49 by 狂炫麦当当
[论文投稿] Journal of Mechanical Science and Technology +3 Russ_ss 2026-03-25 5/250 2026-03-27 10:49 by 陆小果画大饼
[考研] 276求调剂。有半年电池和半年高分子实习经历 +10 材料学257求调剂 2026-03-23 11/550 2026-03-27 10:13 by YCIT- LHL
[考研] 349求调剂 +5 杰斯塔里斯 2026-03-21 5/250 2026-03-27 00:31 by wxiongid
[考研] 071000生物学求调剂，初试成绩343 +6 小小甜面团 2026-03-25 6/300 2026-03-26 23:01 by 不吃魚的貓
[考研] 一志愿厦门大学化学学硕307求调剂 +8 y7czhao 2026-03-26 8/400 2026-03-26 19:51 by 不吃魚的貓
[考研] 086000生物与医药292求调剂 +6 小小陈小小 2026-03-22 9/450 2026-03-26 15:58 by dick_runner
[考研] 303求调剂 +6 蓝山月 2026-03-25 6/300 2026-03-25 22:47 by 418490947
[考研] 材料与化工328分调剂 +6 。，。，。，。i 2026-03-23 6/300 2026-03-25 22:30 by 418490947
[考研] 293求调剂 +7 加一一九 2026-03-24 7/350 2026-03-25 12:02 by userper
[考研] 求调剂 +6 研研，接电话 2026-03-24 7/350 2026-03-24 17:01 by barlinike
[考研] 300求调剂，材料科学英一数二 +5 leaflight 2026-03-24 5/250 2026-03-24 16:25 by laoshidan
[考研] 361求调剂 +3 Glack 2026-03-22 3/150 2026-03-23 22:03 by fuyu_
[考研] 材料学硕301分求调剂 +7 Liyouyumairs 2026-03-21 7/350 2026-03-21 22:31 by peike
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭