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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » PCR相关 » 关于构建系统发育树
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lgxjm123

新虫 (初入文坛)

[求助] 关于构建系统发育树 已有6人参与

我做的是16sDNA测序，在http://www.ezbiocloud.net/上下载比对序列，选择同源性最高的3条序列进行比对，但是做出来的发育树目的序列和比对序列聚不到一起。这是为什么呢，能帮我找到原因么，以下附上做出的发育树图、目的序列、和比对序列，或者用序列帮我建树，求帮助，急！！！
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1楼 2016-03-28 15:15:02
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451350853

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
用软件啊，现在很多好用的软件
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让科研在自己的耕耘下枝繁叶茂
3楼2016-03-29 19:48:34
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lucky0222

铁虫 (初入文坛)
引用回帖:
4楼: Originally posted by lgxjm123 at 2016-03-30 09:57:45
能具体说下么，我用的clustalX和mega,而且我感觉不是软件的问题...

我也是聚不到一块呢，都是下载的相似菌株的序列，MEGA6.0做的发育树，结果都不聚到一起，同求解！
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责任
5楼2016-04-16 11:40:09
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wyy1992

新虫 (初入文坛)
想问楼主问题解决了吗 我也是这样的问题  并且我的菌一直在外面  求助
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10楼2016-05-12 20:48:55
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普通回帖

lgxjm123

新虫 (初入文坛)
没人能找出原因么，或者帮忙建下树也可以啊，被这个烦死了
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2楼2016-03-29 18:02:17
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lgxjm123

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 451350853 at 2016-03-29 19:48:34
用软件啊，现在很多好用的软件

能具体说下么，我用的clustalX和mega,而且我感觉不是软件的问题
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4楼2016-03-30 09:57:45
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lucky0222

铁虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

我跟楼主相似的情况啊，做的也是16sDNA，用的是软件是MEGA6.0，也是聚不到一块，同求解！
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责任
6楼2016-04-16 11:41:30
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biozhajie

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

我认为这个结果有可能不是构树本身的问题，而是你的序列在不同物种间过于保守原因，你看你那些分枝节点的支持度都很低
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7楼2016-04-16 16:26:47
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lucky0222

铁虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

引用回帖:
7楼: Originally posted by biozhajie at 2016-04-16 16:26:47
我认为这个结果有可能不是构树本身的问题，而是你的序列在不同物种间过于保守原因，你看你那些分枝节点的支持度都很低

对于这种情况如何处理？还是说直接就这样作图。主要是给评委看的，他没意见我更无所谓。
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责任
8楼2016-04-18 17:23:20
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biozhajie

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

引用回帖:
8楼: Originally posted by lucky0222 at 2016-04-18 17:23:20
对于这种情况如何处理？还是说直接就这样作图。主要是给评委看的，他没意见我更无所谓。...

关键是你想通过基因树说明什么问题  只要能说清  这些低支持度的分枝就不是问题

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9楼2016-04-18 19:51:24
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