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lgxjm123

新虫 (初入文坛)

[求助] 关于构建系统发育树 已有6人参与

我做的是16sDNA测序,在http://www.ezbiocloud.net/上下载比对序列,选择同源性最高的3条序列进行比对,但是做出来的发育树目的序列和比对序列聚不到一起。这是为什么呢,能帮我找到原因么,以下附上做出的发育树图、目的序列、和比对序列,或者用序列帮我建树,求帮助,急!!!
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451350853

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
用软件啊,现在很多好用的软件
让科研在自己的耕耘下枝繁叶茂
3楼2016-03-29 19:48:34
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lucky0222

铁虫 (初入文坛)

引用回帖:
4楼: Originally posted by lgxjm123 at 2016-03-30 09:57:45
能具体说下么,我用的clustalX和mega,而且我感觉不是软件的问题...

我也是聚不到一块呢,都是下载的相似菌株的序列,MEGA6.0做的发育树,结果都不聚到一起,同求解!
责任
5楼2016-04-16 11:40:09
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wyy1992

新虫 (初入文坛)

想问楼主问题解决了吗 我也是这样的问题  并且我的菌一直在外面  求助
10楼2016-05-12 20:48:55
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普通回帖

lgxjm123

新虫 (初入文坛)

没人能找出原因么,或者帮忙建下树也可以啊,被这个烦死了
2楼2016-03-29 18:02:17
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lgxjm123

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 451350853 at 2016-03-29 19:48:34
用软件啊,现在很多好用的软件

能具体说下么,我用的clustalX和mega,而且我感觉不是软件的问题
4楼2016-03-30 09:57:45
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lucky0222

铁虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

我跟楼主相似的情况啊,做的也是16sDNA,用的是软件是MEGA6.0,也是聚不到一块,同求解!
责任
6楼2016-04-16 11:41:30
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biozhajie

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

我认为这个结果有可能不是构树本身的问题,而是你的序列在不同物种间过于保守原因,你看你那些分枝节点的支持度都很低
7楼2016-04-16 16:26:47
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lucky0222

铁虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

引用回帖:
7楼: Originally posted by biozhajie at 2016-04-16 16:26:47
我认为这个结果有可能不是构树本身的问题,而是你的序列在不同物种间过于保守原因,你看你那些分枝节点的支持度都很低

对于这种情况如何处理?还是说直接就这样作图。主要是给评委看的,他没意见我更无所谓。
责任
8楼2016-04-18 17:23:20
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biozhajie

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

引用回帖:
8楼: Originally posted by lucky0222 at 2016-04-18 17:23:20
对于这种情况如何处理?还是说直接就这样作图。主要是给评委看的,他没意见我更无所谓。...

关键是你想通过基因树说明什么问题  只要能说清  这些低支持度的分枝就不是问题

发自小木虫Android客户端
9楼2016-04-18 19:51:24
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