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分类 共搜索到 53 个相关话题(最多显示前5000个) 作者 最后发表
分子生物 简并引物的特异性
新手求助打算用qPCR从cDNA里筛一个片段,没有相关的文献资料,所以用j-codehop设计了简并引物。用oligocalc检查了没有问题,现在想确定一下引物的特异性。之前看的帖子都是用primer-blast,...
hqyqh1314 2022-08-31 06:54
硕博家园 j-CODEHOP的使用
请问有用j-CODEHOP软件设计简并引物的朋友吗?
药化刘 2021-02-25 07:44
硕博家园 求可用的 CODEHOP和 iCODEHOP网址。
初学兼并引物设计,我文献里找到了一个打开iCODEHOP的网址'https://icodehop.cphi.washington.edu/i-codehop-context/Welcome.'但是在我的360,谷歌和火狐浏览器上都打不开,请问是这个网址...
药化刘 2021-02-17 12:57
有奖问答 COnsensus-DEgenerate Hybrid Oligonucleotide Primer(CODEHOP)...
有谁最近有用COnsensus-DEgenerateHybridOligonucleotidePrimer(CODEHOP)strategy设计引物吗?或者iCODEHOPisfreelyavailabletoallinterestedresearchersat'...
戴晓凤 2018-12-11 07:42
分子生物 简并引物的设计以及PCR疑问,求助
2、我使用CODEHOP软件设计了两次引物,自己手动选择保守序列区域设计了一次引物,温度梯度PCR都试过了,但均没有结果,请问大家有没有什么设计兼并引物的建议?PCR时简并引物加的量需要增加...
长大的小鱼93 2017-12-28 01:26
分子生物 如何设计简并引物?
如题,有人会用primer或是codehop设计简并引物吗?求大神帮忙!
cheny21 2017-08-04 08:12
休闲灌水 求指导引物设计
初学引物设计,用codehop找到保守区,怎么样利用pp5软件进行引物设计
鱼儿小伙伴 2017-04-27 02:27
分子生物 CODEHOP设计兼并引物疑问
请问用CODEHOP设计兼并引物,在lookingforprimers之后选取一Blockunknown_A的一条作为上游引物,之后返回lookingforprimers稍微改变温度条件再lookingforprimers选取Blockunknown_G的一条...
方天翼614 2016-10-28 01:58
分子生物 利用CODEHOP软件简并引物设计
已经设计了一对引物,可以得到目的条带,但筛选不出来,现在重新设计,希望可以筛选到,有几个问题,希望大家帮忙解答~1.利用我自己的产酶基因(来源里氏木霉)在NCBI中进行blastx(核酸blast...
张小蛋 2016-10-13 02:06
分子生物 各位亲们,请教Codehop设计简并引物的问题
1.我知道Blockunknown_A和ComplementofBlockunknown_A分别为上游引物和下游引物,Blockmaker会把一个氨基酸序列分成好几个区,想问的是我可以自由的从Blockunknown_A选择一条上游引物,然后...
sandycool 2016-04-15 06:05
分子生物 新手关于CODEHOP结果筛选有几个问题请教大家
下面放部分CODEHOP的引物结果ComplementofBlockPALxxxx_AOligosWVMESMNKGTDSYGVTTGFGATSacccantacctTAGATACTTATTCCCTTGACT-5'Core:degen=4len=11Clamp:score=76,len=21temp=60.4...
苯丙氨酸-PAL 2015-11-01 10:50
分子生物 CODEHOP简并引物结果怎么看
利用CODEHOP设计简并引物后给出的结果是这样的:5'-TCTCCGGCGGCcayntnaaycc-3',我想知道这就是简并引物吗?后面那一串小写的字母是什么意思?要是合成引物的话就这么写吗?
草蔻年华 2015-06-30 08:42
分子生物 CODEHOP 结果怎么看以及简并引物设计相关问题
CODEHOP结果怎么看?下面是我用CODEHOP设计简并引物的结果,1、不知道怎么选择,A、B、C、D、中哪个是上游引物,哪个是下游引物?怎么知道简并引物之间的距离?引物的选择有什么要求?另外2...
308047410 2015-05-20 08:16
分子生物 CODEHOP简并引物,用以P细菌漆酶基因,Codon usage table 该选...
如题,希望大神们指点一二,多谢
chenjunhai 2015-04-22 08:38
分子生物 植物功能基因实验设计
2、利用简并引物法设计引物(用Codehop设计的,不知道选择的引物适不适合),结合巢式PCR,得到一段较保守的的序列,直接连接T载体。宝生的pMD18-T,报价500,Promega的pGEM-T报价350,查说...
Ivy尘 2014-12-16 01:30
分子生物 BlockMaker算出来的保守区放到CODEHOP里的格式,有个地方不懂是...
如下:IDunknown;BLOCKACunknown_A;distancefrompreviousblock=(66,66)DEacetolactatesynthase[LactobacillusfermentumIFO.familyBLFPG;width=32;seqs=26;99.5%1655;strength=1471gi|...
na466433306 2014-09-03 02:56
资源求助完结子版 如何选择用CODEHOP设计的简并引物
最近用CODEHOP设计简并引物,结果出来的引物很多,该怎么选择啊?听说oligo6评估引物很好,我就自学了,可只会普通的PCR引物评估,不会简并引物的,我的简并引物是根据保守氨基酸序列设计的...
心有灵龙一 2014-04-04 03:03
文献求助完结子版 CODEHOP PCR and CODEHOP PCR primer design 匿名 2014-01-13 08:49
分子生物 iCODEHOP 兼并引物设计
初学兼并引物设计,蛋白序列用blockmaker处理后,得到18个block(序列比较长),然后我将其中的一个block复制粘贴到CODEHOP的网站,计算结果显示Nocorrectlyformattedblocksfoundtoprocess...
19751223 2014-01-03 06:36
分子生物 设计了简并引物,PCR扩不出条带
本人欲克隆一条未知基因,从NCBI上下了几条其他物种上的该基因,应用CODEHOP结合BlockMaker设计了几条简并引物,都没有扩出条带。首先确定cDNA是没问题的,已经用Actin验证过;PCR也用了...
wh6125 2013-10-31 02:45
资源求助完结子版 codhop设计简并引物的方法
目前通过网站进入'http://blocks.fhcrc.org/codehop.html'界面,将几条氨基酸序列输入到blockmaker,然后Blocksformatter,得到Blocks,将其复制粘贴到新的界面,lookfor...
mah2012 2013-10-15 01:15
分子生物 求助兼并引物设计在线软件
最近在设计兼并引物,用的事Codehop在线软件,但是用blockmaker在线block时遇到了问题,总是出现错误。想问一下是不是把几条氨基酸序列以FASTA格式下好了以后,放在一个txt里,然后上传到...
wh6125 2013-10-09 02:23
硕博家园 CODEHOP 收不到block maker的邮件?
CODEHOP在线设计引物,blockmaker完两天半啦,怎么还是收不到邮件?
emily-lhy 2013-04-25 07:56
分子生物 求助 急切 请问哪位高手会用CODEHOP这个软件
有没有人会用CODEHOP这个软件啊我想设计简并引物,可是用这个软件出来的结果我咋看不懂呢求教求教
zfox 2013-04-07 01:09
文献求助完结子版 CODEHOP PCR and CODEHOP PCR Primer Design 匿名 2013-03-13 08:48