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[求助]
利用CODEHOP软件简并引物设计
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已经设计了一对引物，可以得到目的条带，但筛选不出来，现在重新设计，希望可以筛选到，有几个问题，希望大家帮忙解答~ 1.利用我自己的产酶基因(来源里氏木霉)在NCBI中进行blastx(核酸blast蛋白)，得到一百条同源序列，ident有高有低，将这100条保存成fasta格式，保守序列对比 问题:我选的序列是否合理，多不多，还是只选择几个有代表性的？ 2.codon usage table中没有我的里氏木霉，倒是有相似性75%的Neurospora crassa 我可以选这个嘛？该怎么选呢？ 3.目的:从土壤中筛选未培养产酶微生物 如果这次成功，一定写一个分享教程，希望大家帮帮我啊~ 发自小木虫Android客户端 |
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xn8008: 欢迎发帖交流 2016-10-13 11:45:54
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补充:对于第二个codon usage table的选择问题上，我考虑的是怕选择75%相似性的这个，土壤中可能含量很少~有点不太明白，希望大家答疑解惑 发自小木虫Android客户端 |
2楼2016-10-13 10:23:04