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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » PCR相关 » 各位亲们，请教Codehop设计简并引物的问题
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sandycool

铁虫 (正式写手)

[求助] 各位亲们，请教Codehop设计简并引物的问题

1.我知道Block unknown_A和Complement of Block unknown_A分别为上游引物和下游引物，Block maker 会把一个氨基酸序列分成好几个区，想问的是我可以自由的从Block unknown_A选择一条上游引物，然后，从Complement of Block unknown_E选择一条下游引物么？
2.选择完上游引物和下游引物之后，如何对这对引物进行检测，以避免错配，二聚体等现象。

各位亲们，请教Codehop设计简并引物的问题


各位亲们，请教Codehop设计简并引物的问题-1


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1楼 2016-04-15 14:47:05
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sandycool

铁虫 (正式写手)
3.是否简并度越低越好呢？我选择引物的根据是得分高，简并度低的条件，结合保守区尽量是M，W。避免L，R，S，并且控制产物的长度来进行筛选的。

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2楼2016-04-15 14:51:03
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sandycool

铁虫 (正式写手)
有没有大神出来解读一下啊？

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3楼2016-04-15 15:39:21
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sandycool

铁虫 (正式写手)
亲们，有没有用codehop设计引物的啊？麻烦指导一下下呗

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4楼2016-04-16 08:05:10
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折红兵

新虫 (初入文坛)
你好，请问你用codehop软件设计的引物好用么？我最近也在做同源克隆。但是pcr不出东西。
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5楼2016-07-07 17:09:58
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明日天涯线

金虫 (小有名气)
楼主上述问题现在明白了么？求回复一下，我现在也不明白这些问题。
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6楼2017-12-13 14:28:39
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