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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » CODEHOP设计兼并引物疑问
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方天翼614

新虫 (小有名气)

[交流] CODEHOP设计兼并引物疑问 已有2人参与

请问用CODEHOP设计兼并引物，在looking for primers之后选取一Block unknown__A的一条作为上游引物，之后返回looking for primers稍微改变温度条件再looking for primers选取Block unknown__G的一条作为下游引物，可以吗？
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1楼 2016-10-28 21:00:58
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rodickholm

木虫 (正式写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
现在都转录组了，没人设计这个了
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2楼2016-10-31 15:30:14
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方天翼614

新虫 (小有名气)
实验室做传统分类，刚往分子方面涉及，没有近源物种的库，好多文献需要设计兼并引物呀？其他也不懂啊

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3楼2016-10-31 20:22:20
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饺子弟

铜虫 (小有名气)
应该可以的。

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4楼2016-11-01 22:12:23
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方天翼614

新虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by rodickholm at 2016-10-31 15:30:14
现在都转录组了，没人设计这个了

谢谢帮助，麻烦一下，当设计的引物出现同聚串（GCTCCATGtggtggggnat）碱基重复，可以用吗？怎样避免啊？

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5楼2016-11-03 15:37:36
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方天翼614

新虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by 饺子弟 at 2016-11-01 22:12:23
应该可以的。

谢谢帮助

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6楼2016-11-03 15:37:57
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rodickholm

木虫 (正式写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
5楼: Originally posted by 方天翼614 at 2016-11-03 15:37:36
谢谢帮助，麻烦一下，当设计的引物出现同聚串（GCTCCATGtggtggggnat）碱基重复，可以用吗？怎样避免啊？
...

引物行不行要试了才知道，设一对巢式做二轮，出的机率大些

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7楼2016-11-03 18:52:42
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方天翼614

新虫 (小有名气)
引用回帖:
7楼: Originally posted by rodickholm at 2016-11-03 18:52:42
引物行不行要试了才知道，设一对巢式做二轮，出的机率大些
...

三克油

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8楼2016-11-03 19:33:54
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