应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » PCR相关 » BSP 甲基化引物设计
41/1返回列表
查看: 2985  |  回复: 3
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

upgo123

金虫 (小有名气)

[求助] BSP 甲基化引物设计 已有1人参与

我BSP检测基因甲基化，但序列中CG太多，无法避开。
所以引物中含有兼并碱基。上游引物中有个Y,下游有个R.
通过Methyl primer Express设计，我想自己把引物长度修改下，但Methyl primer Express无法编辑，我用过Primer 5.0 编辑，但引物中如果有Y,R的话，Primer 5.0却不显示退火温度。
请各位帮忙！不甚感激。@biostar2009
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
选择，然后坚持
1楼 2016-02-18 16:01:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

KOP利

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
引物设计我可以帮你设计，但后面的甲基化检测实验也要交给我去做才行。关于BSP法检测甲基化，需要你提供基因序列，最好是登录号，我这里的软件可以帮你分析CpG岛，并设计引物合成序列等。
赞一下 回复此楼
YNWA！
2楼2016-02-19 09:00:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

upgo123

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by KOP利 at 2016-02-19 09:00:01
引物设计我可以帮你设计，但后面的甲基化检测实验也要交给我去做才行。关于BSP法检测甲基化，需要你提供基因序列，最好是登录号，我这里的软件可以帮你分析CpG岛，并设计引物合成序列等。

那 甲基化引物 的质量评价标准或原则是什么呢？比如不可有引物二聚体、不可有引物自联等，但甲基化引物肯定避免不了自联啊。该怎么处理？直接忽略？还是其他？
另外，引物中应不应该有GC夹？多少合适呢？
谢谢！
赞一下 回复此楼
选择，然后坚持
3楼2016-02-19 11:27:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

KOP利

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by upgo123 at 2016-02-19 11:27:46
那 甲基化引物 的质量评价标准或原则是什么呢？比如不可有引物二聚体、不可有引物自联等，但甲基化引物肯定避免不了自联啊。该怎么处理？直接忽略？还是其他？
另外，引物中应不应该有GC夹？多少合适呢？
谢谢！...

我这里是做实验服务的，你在上海吗？
赞一下 回复此楼
YNWA！
4楼2016-02-19 13:08:36
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 upgo123 的主题更新
41/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 售SCI文章，我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +6 LwdutQ8HoqWP 2026-09-13 6/300 2026-09-16 15:24 by i3KBRD19ERkG
[考博] 上海工程技术大学激光智能制造课题组｜2027级博士研究生招生公告 +7 水士口 2026-09-16 8/400 2026-09-16 13:47 by kkklens
[博后之家] 售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +3 vZfe6xYu34yj 2026-09-14 3/150 2026-09-16 08:27 by SjQobnC04j06
[硕博家园] 售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +4 40ms4Wlo4umh 2026-09-14 4/200 2026-09-16 06:27 by LH5NkK5Ud4bh
[考研] 售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +3 23jxep3nCNZb 2026-09-14 3/150 2026-09-16 06:11 by LH5NkK5Ud4bh
[硕博家园] 售SCI一区文章，我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +3 6F5UbRU2I5hL 2026-09-14 3/150 2026-09-16 05:27 by LH5NkK5Ud4bh
[博后之家] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +3 6F5UbRU2I5hL 2026-09-14 3/150 2026-09-16 04:47 by LH5NkK5Ud4bh
[博后之家] 售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +4 s3fFTmArrBt6 2026-09-14 4/200 2026-09-16 04:27 by DgNGHc3h5tPl
[找工作] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +4 s3fFTmArrBt6 2026-09-13 5/250 2026-09-16 03:59 by DgNGHc3h5tPl
[硕博家园] 售SCI一区文章，我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +4 s3fFTmArrBt6 2026-09-13 6/300 2026-09-16 03:50 by DgNGHc3h5tPl
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +5 QUjhNVAcOSff 2026-09-13 5/250 2026-09-16 02:14 by DgNGHc3h5tPl
[博后之家] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +3 Aj1rhIDL5ixY 2026-09-14 3/150 2026-09-15 20:59 by zNcEhTcH7ihq
[考研] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 6F5UbRU2I5hL 2026-09-14 3/150 2026-09-15 17:15 by CgyNCDVNhGVg
[考研] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +5 s3fFTmArrBt6 2026-09-14 5/250 2026-09-15 16:59 by CgyNCDVNhGVg
[考研] 售SCI一区文章，我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +6 QUjhNVAcOSff 2026-09-13 7/350 2026-09-15 14:22 by VMDqgnlKimtZ
[考博] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 6F5UbRU2I5hL 2026-09-14 3/150 2026-09-15 07:58 by C79jjtjAKjEn
[教师之家] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +4 6F5UbRU2I5hL 2026-09-14 4/200 2026-09-15 07:50 by C79jjtjAKjEn
[博后之家] 售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +3 s3fFTmArrBt6 2026-09-13 4/200 2026-09-14 23:24 by vZfe6xYu34yj
[教师之家] 售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 LwdutQ8HoqWP 2026-09-13 4/200 2026-09-14 16:13 by Aj1rhIDL5ixY
[考博] 27秋季材料博士申请求助 10+3 Cahal1 2026-09-11 4/200 2026-09-14 08:50 by 北京莱茵编辑
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭