24小时热门版块排行榜    

查看: 1856  |  回复: 7

会飞的鱼622

新虫 (初入文坛)

[求助] 假单胞菌 同源重组 插入突变 蔗糖筛选 已有2人参与

各位大侠请求帮助
我做的是假单胞菌羧卞抗性的基因敲除试验,选用的自杀质粒是PJQ200sk  gent抗性,将基因的ATG上下游500-600bp片段扩增出来,在ATG下游20bp左右插入卡那霉素抗性基因,然后连入PJQ200sk   
1.进行三亲杂交,在卡那霉素和羧卞的平板上长斑,pcr验证能够检测到突变后基因大小的片段,但是扩增不出来假单胞菌其他的基因,蔗糖筛选后也一样
2.进行电转,在卡那霉素和羧卞的平板上长斑,菌液pcr目的基因和其他基因都扩增不到,能再蔗糖板上张,也能在gent抗性的培养基中张
各位大侠帮帮忙

发自小木虫Android客户端
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

岳大白

新虫 (初入文坛)

我和你做的差不多,目前是单交换进行的不顺利,也不知道什么原因

发自小木虫Android客户端
2楼2016-02-23 15:55:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

岳大白

新虫 (初入文坛)

你的三亲杂交是怎么做的,用没用到辅助质粒,能和我说说吗?

发自小木虫Android客户端
3楼2016-02-23 15:56:24
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

quiller2000

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
西门吹雪170: 金币+3, 鼓励回帖交流 2016-02-23 22:22:54
是杂菌吗?

1 是否有gen的抗性?
2 用单抗平板测试你的供体菌,受体菌和辅助菌确实能够用来筛选,而没有其它交叉的抗性
3 关于sacB的问题,在假单胞菌中本来就用的不大好,反正我们的是这样
4 三亲本后,挑取的单菌落多划线几次,然后用蔗糖筛选也是多划线几次--- ---别染杂菌了
5 主要看pcr的结果吧  sacB不是太好用,或者你的基因是条件致死了,长出来的都是突变了的,那就搞不定了

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

致良知
4楼2016-02-23 19:00:41
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

会飞的鱼622

新虫 (初入文坛)

送红花一朵
引用回帖:
4楼: Originally posted by quiller2000 at 2016-02-23 19:00:41
是杂菌吗?

1 是否有gen的抗性?
2 用单抗平板测试你的供体菌,受体菌和辅助菌确实能够用来筛选,而没有其它交叉的抗性
3 关于sacB的问题,在假单胞菌中本来就用的不大好,反正我们的是这样
4 三亲本后,挑取 ...

是说我的双抗筛选后获得的单克隆是否有gent抗性是吗?
我的电转化后得到的转化子是有gent抗性的,三亲结合没试过是否有gent抗性
我做的基因不是致死基因
抗生素交叉抗性的问题,我试过辅助菌和供体菌两种菌不抗羧卞,受体菌不抗kana
麻烦帮我在分析一下可能还是哪些方面的问题

发自小木虫Android客户端
5楼2016-02-26 19:06:24
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

会飞的鱼622

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 岳大白 at 2016-02-23 15:56:24
你的三亲杂交是怎么做的,用没用到辅助质粒,能和我说说吗?

用辅助菌helper菌株

发自小木虫Android客户端
6楼2016-02-26 19:07:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

su2008su11

木虫 (正式写手)

想咨询一下,您将构建的片段,连接进自杀质粒的时候,用的是哪家公司的T4连接酶?是宝生物(TAKARA)吗?
一命二运三风水四积阴德五读书
7楼2016-12-07 01:11:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

远丽123

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

你好 我的问题和你的一模一样,我也是假单胞菌,我用的自杀质粒是pEX18GM,辅助菌是pRK600,我也是三亲后涂平板验证是对的(用敲出基因的1和4引物以及其他基因的引物都是有的,说明是单交换成功的菌),但是我再次挑目的菌在LB平板上划线时,就一点也长不出来了,偶尔会有一点点的菌长出来,但是用假单胞菌的其他基因来扩就扩不出,而且蔗糖后用敲除的1和4 引物验证还是对的,但是假单胞菌的其他基因还是没有,我就把蔗糖后的菌拿去测序,发现是大肠杆菌。我的猜测是单交换的假单胞菌死掉了(不明白为什么死掉,抗生素的选择是合适的),在LB上长出来的一点点的菌就是供体菌。但是为什么会这样我就不明白了,这一步也是卡了很久了,请问你后来问题解决了吗??能否告知如何解决的,万分感谢!!
8楼2017-12-28 15:59:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 会飞的鱼622 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +3 hKe7U1kad5Sg 2026-10-31 6/300 2026-11-01 22:11 by xzcv0Tehd8lQ
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +5 xvJS1BYDxvBS 2026-10-31 10/500 2026-11-01 21:52 by xzcv0Tehd8lQ
[考博] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +5 1uaZt2kAZj2S 2026-10-31 7/350 2026-11-01 21:45 by xzcv0Tehd8lQ
[考博] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +5 1uaZt2kAZj2S 2026-10-30 17/850 2026-11-01 21:26 by xzcv0Tehd8lQ
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +3 hKe7U1kad5Sg 2026-10-31 5/250 2026-11-01 20:03 by xzcv0Tehd8lQ
[考研] 售一区SCI文章T0P,我:8O.551.O54,科目全,可十急 +3 hKe7U1kad5Sg 2026-10-31 6/300 2026-11-01 19:50 by xzcv0Tehd8lQ
[公派出国] 售一区SCI文章T0P,我:8O.551.O54,科目全,可十急 +5 1uaZt2kAZj2S 2026-10-31 7/350 2026-11-01 16:58 by BCdvBAEpt3zm
[博后之家] 售SCI一区文章,我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +4 1uaZt2kAZj2S 2026-10-31 8/400 2026-11-01 16:58 by BCdvBAEpt3zm
[基金申请] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +6 X5bHxOULxFqb 2026-10-30 22/1100 2026-11-01 16:35 by BCdvBAEpt3zm
[考博] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +3 hKe7U1kad5Sg 2026-10-31 7/350 2026-11-01 15:08 by BCdvBAEpt3zm
[公派出国] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 1uaZt2kAZj2S 2026-10-30 14/700 2026-11-01 14:24 by BCdvBAEpt3zm
[基金申请] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +3 xvJS1BYDxvBS 2026-10-31 3/150 2026-11-01 12:53 by BCdvBAEpt3zm
[考研] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +3 xvJS1BYDxvBS 2026-10-31 5/250 2026-11-01 12:51 by BCdvBAEpt3zm
[硕博家园] 售一区SCI文章T0P,我:8O.551.O54,科目全,可十急 +3 1uaZt2kAZj2S 2026-10-30 13/650 2026-11-01 12:14 by BCdvBAEpt3zm
[公派出国] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +3 hKe7U1kad5Sg 2026-10-31 5/250 2026-11-01 11:14 by BCdvBAEpt3zm
[考博] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 xvJS1BYDxvBS 2026-10-31 4/200 2026-11-01 11:01 by BCdvBAEpt3zm
[论文投稿] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +5 X5bHxOULxFqb 2026-10-30 26/1300 2026-11-01 10:22 by BCdvBAEpt3zm
[博后之家] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 1uaZt2kAZj2S 2026-10-30 15/750 2026-11-01 05:22 by YXM1FDCSE8Bn
[硕博家园] 申博自荐 2篇一区TOP+1篇EI+2公开发明专利 2027博士申请 +3 小小阿光 2026-10-27 3/150 2026-10-29 23:56 by 起风了的快乐
[考博] 申博求助 20+3 Katrinae 2026-10-26 4/200 2026-10-27 09:56 by 北京莱茵编辑
信息提示
请填处理意见