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shapuofeng1

新虫 (初入文坛)

[求助] 杂带较多,如何处理 已有7人参与

我现在对温度进行考察,40个循环,温度高条带不好,温度低杂带太多,问大神如何处理?总50ul,引物各2ul(20uM),模板4ul,水17ul,混合物25ul。我需要对引物和模板进行调整吗?变性94℃,延伸72℃,退火在39-45之间。

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njrice

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
退火温度太低了,可以在60度左右
保持乐观
6楼2016-01-24 18:47:31
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分子2010

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
退火温度太低,可以升高看看。高温会增强引物特异性并减少杂带。如果还是不行,可以适当调整模板和引物的量
科研是条不归路!
7楼2016-01-25 13:44:22
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曾文正公

金虫 (著名写手)

退火温度怎么这么低  一般都是55-60啊
只有非常努力,才能看起来毫不费力
14楼2016-01-25 23:46:37
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普通回帖

shapuofeng1

新虫 (初入文坛)

2楼2016-01-24 16:48:30
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shapuofeng1

新虫 (初入文坛)

如图

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  • 2016-01-24 17:05:41, 475.89 K
3楼2016-01-24 17:06:00
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shapuofeng1

新虫 (初入文坛)

12
杂带较多,如何处理
2016-1-24(1-23-1 PCR重复12次)1副本.jpg

4楼2016-01-24 17:08:10
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原海亮

木虫 (著名写手)


西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2016-01-24 22:21:00
模板是什么呢?话说温度梯度也太小了吧,我们常做50-70度。

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天空才是极限,我有信心飞的更高!
5楼2016-01-24 18:46:19
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jinfangli

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
退火温度过低,55-75摄氏度,温度越高特异性越好,选择最高温度P出来的条带
fight
8楼2016-01-25 14:54:25
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memorize1991

木虫 (正式写手)

退火选55度到60度之间试一下,可以用PCR仪以1度为梯度选择合适的变性温度。你温度太低了,还有,你扩的基因有多大?复性的时间等你检查一下,……我扩过的目的基因一般在250bp左右,从变性到延伸的循环一般2小时就够了。调整好P的温度后,如果还有问题就分析一下操作和材料的问题吧。

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9楼2016-01-25 15:41:34
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丝竹睛明

新虫 (小有名气)

引物设计温度太低了,我们实验室都是统一60℃附近

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10楼2016-01-25 21:19:17
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