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cyl-1

铜虫 (初入文坛)

[求助] 关于red重组的问题已有1人参与

各位虫友大家好,最近在做red重组敲除沙门氏菌的两个基因,其中有一个已经做成功,另外一个在转入同源壁片段之后,在抗性板子上长出了几个斑,挑斑用抗性LB摇菌。在要敲除的基因两侧和内部分别设计两对引物进行pcr鉴定,这时奇怪的事发生了,在基因两侧设计的引物扩增出来两条带,一大一小,测序后大的一条为该目的基因序列,小的一条为抗性基因序列,为什么会发生这种事,抗性片段应该是交换上去了,不然在抗性板子上不会长,应该没有污染,每次都做了阴性对照,没有条带,而且后来用菌液划了两次抗性板子挑单菌落 纯化,但是还是扩展出来两条带,基本可以排除污染的可能。后来我在genebank上找了一下标准沙门的序列,没有多拷贝,到底是怎么回事???求高手指导。

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cyl-1

铜虫 (初入文坛)

内部的引物也扩出和野生株一样的条带

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2楼2016-01-15 16:08:05
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poiu250

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖


xn8008: 金币+1, 欢迎发帖交流 2016-10-26 08:39:50
请问楼主知道,怎么利用设计引物,来鉴定敲除10来个碱基的小鼠吗?设计的原理是 什么?
3楼2016-10-22 13:24:31
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cyl-1

铜虫 (初入文坛)


xn8008: 金币+1, 欢迎发帖交流 2016-10-26 08:39:56
引用回帖:
3楼: Originally posted by poiu250 at 2016-10-22 13:24:31
请问楼主知道,怎么利用设计引物,来鉴定敲除10来个碱基的小鼠吗?设计的原理是 什么?

提取敲除了基因的小鼠基因组,在你敲除的基因两侧设计引物,pcr扩增然后测序比对就知道了

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4楼2016-10-26 08:02:59
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