24小时热门版块排行榜    

查看: 2423  |  回复: 9

wcq吴超群

新虫 (小有名气)

[求助] 如何鉴定一株分离得到的内生真菌是否为新种??? 已有1人参与

本人刚刚开始接触植物内生真菌,有些问题想请教下。目前,有一株分离自植物的炭角菌,是我一个毕业了的师姐分离出来的。她当时测了这株真菌的ITS片段序列,NCBI数据库的比对结果和某种炭角菌相似度达到98%,然后又测了该株真菌的RPB2片段序列,序列对比结果和另外某种炭角菌相似度达98%,又结合部分形态特征,依此鉴定为炭角菌,但是我不明白她为什么毕业论文中说是分离到炭角菌新种?
          我看论坛中有人说序列相似度在97%以下,才有可能是新种。另外,当时师姐没能诱导产子囊壳和孢子,只拍了子座的显微结构,我们导师(对真菌了解不多)现在想让我试试诱导产孢,写一篇真菌新种发布的文章。但是根据序列相似度,我现在怀疑当时分离到的可能就不是新种。所以想请教下大家,否则后边的诱导实验都是徒劳。另外,我看了一些新种的发布文章,都是只涉及性状和显微结构的描述,好像也没有说要把分子鉴定的写上去啊?小白,虚心求教。
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jhonrambo

新虫 (小有名气)

2楼2016-01-15 00:54:39
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wcq吴超群

新虫 (小有名气)

3楼2016-01-15 09:38:23
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

books

木虫 (小有名气)

重新再做比对,检查一下。

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
4楼2016-01-15 09:47:03
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

张晓腾58

新虫 (正式写手)

序列比对,显微结构观察,比较不同差异很大!就可以!我原来做的一株虫草,基因序列单基因,多基因比对都有差异不是很大!但是产孢结构差异很大!  又和相似那个菌株做培养,结构比对!就可以了!

发自小木虫Android客户端
5楼2016-01-15 14:18:39
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wcq吴超群

新虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by 张晓腾58 at 2016-01-15 14:18:39
序列比对,显微结构观察,比较不同差异很大!就可以!我原来做的一株虫草,基因序列单基因,多基因比对都有差异不是很大!但是产孢结构差异很大!  又和相似那个菌株做培养,结构比对!就可以了!
...

OK

发自小木虫Android客户端
6楼2016-01-15 16:41:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wcq吴超群

新虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by 张晓腾58 at 2016-01-15 14:18:39
序列比对,显微结构观察,比较不同差异很大!就可以!我原来做的一株虫草,基因序列单基因,多基因比对都有差异不是很大!但是产孢结构差异很大!  又和相似那个菌株做培养,结构比对!就可以了!
...

感谢

发自小木虫Android客户端
7楼2016-01-15 16:42:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wcq吴超群

新虫 (小有名气)

8楼2016-01-16 19:50:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

美亿美生物

捐助贵宾 (职业作家)

技术服务-实验代做


【答案】应助回帖

商家已经主动声明此回帖可能含有宣传内容
97%以下为相似度较低,可以提交序列申请登录号。如果较高的话,基本可以根据库里面的比对信息,判断为一致。
分子方面的鉴定还是比较简单的。提取,引物扩增,克隆测序,比对建树。
可以联系我们进行处理。北京美亿美生物回复以上,祝好
9楼2016-01-18 11:07:35
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

那一沐,星辰

新虫 (正式写手)

内容已删除
10楼2021-08-05 17:46:45
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 wcq吴超群 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[职场人生] 40+中年人失业后,还能找到好工作吗? +11 xqy2009 2026-10-13 13/650 2026-10-15 21:32 by bear2007
[有机交流] 用NBS溴化时溶剂除了CCl4外还有什么 +3 18834002860 2026-10-12 6/300 2026-10-15 14:30 by 长沙摩尔信息科�
[基金申请] 申请科研项目纯靠实力能成功吗? 200+7 David1982 2026-10-13 11/550 2026-10-15 10:30 by zyqchem
[硕博家园] 极限拉扯,如何抉择 +11 Isak0320 2026-10-12 15/750 2026-10-14 21:55 by 猫鱼不是鱼
[论文投稿] 二审4个多月了还是Awaiting Reviewer Scores 10+3 纳斯达克ML 2026-10-11 4/200 2026-10-14 17:30 by babero
[有机交流] OpenAI又攻克数学难题了,离AI做有机合成还有多远? +8 wangyl_123 2026-10-10 13/650 2026-10-14 15:12 by zuesli
[教师之家] 课题组会帮你通过考核么? +4 好运来~9527 2026-10-10 7/350 2026-10-13 08:41 by xli1984
[公派出国] 售一区SCI文章T0P,我:8O.551.O54,科目全,可十急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 9/450 2026-10-11 22:34 by XQNyDCa1Tk5n
[找工作] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 8/400 2026-10-11 22:26 by XQNyDCa1Tk5n
[公派出国] 售SCI一区文章,我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 10/500 2026-10-11 22:26 by XQNyDCa1Tk5n
[考博] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 9/450 2026-10-11 22:15 by XQNyDCa1Tk5n
[考博] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 7/350 2026-10-11 22:11 by XQNyDCa1Tk5n
[教师之家] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 (EPI+-1)(金币-50) +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 10/500 2026-10-11 22:06 by XQNyDCa1Tk5n
[教师之家] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 (EPI+-1)(金币-50) +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 10/500 2026-10-11 14:25 by VOMexwnDzOFZ
[教师之家] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 (EPI+-1)(金币-50) +4 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 7/350 2026-10-11 14:05 by VOMexwnDzOFZ
[考研] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 8/400 2026-10-11 13:51 by VOMexwnDzOFZ
[找工作] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 7/350 2026-10-11 10:54 by VOMexwnDzOFZ
[找工作] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +4 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 7/350 2026-10-11 10:34 by VOMexwnDzOFZ
[考博] 招收博士生一名 +3 mandolin 2026-10-10 3/150 2026-10-11 10:21 by 不是山谷!
[公派出国] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +4 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 4/200 2026-10-11 03:14 by M0zrYVSAnxpE
信息提示
请填处理意见