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如何鉴定一株分离得到的内生真菌是否为新种？？？已有1人参与
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本人刚刚开始接触植物内生真菌，有些问题想请教下。目前，有一株分离自植物的炭角菌，是我一个毕业了的师姐分离出来的。她当时测了这株真菌的ITS片段序列，NCBI数据库的比对结果和某种炭角菌相似度达到98%，然后又测了该株真菌的RPB2片段序列，序列对比结果和另外某种炭角菌相似度达98%，又结合部分形态特征，依此鉴定为炭角菌，但是我不明白她为什么毕业论文中说是分离到炭角菌新种？ 我看论坛中有人说序列相似度在97%以下，才有可能是新种。另外，当时师姐没能诱导产子囊壳和孢子，只拍了子座的显微结构，我们导师（对真菌了解不多）现在想让我试试诱导产孢，写一篇真菌新种发布的文章。但是根据序列相似度，我现在怀疑当时分离到的可能就不是新种。所以想请教下大家，否则后边的诱导实验都是徒劳。另外，我看了一些新种的发布文章，都是只涉及性状和显微结构的描述，好像也没有说要把分子鉴定的写上去啊？小白，虚心求教。 |
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4楼2016-01-15 09:47:03
张晓腾58
新虫 (正式写手)
- 应助: 1 (幼儿园)
- 金币: 5481.5
- 红花: 5
- 帖子: 560
- 在线: 91.6小时
- 虫号: 4006790
- 注册: 2015-08-05
- 性别: GG
- 专业: 微生物生理与生物化学
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序列比对，显微结构观察，比较不同差异很大！就可以！我原来做的一株虫草，基因序列单基因，多基因比对都有差异不是很大！但是产孢结构差异很大！ 又和相似那个菌株做培养，结构比对！就可以了！ 发自小木虫Android客户端 |
5楼2016-01-15 14:18:39