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小哥卓尼

新虫 (初入文坛)

[求助] 如何设计针对某一病毒属的引物? 已有1人参与

大家好,我在鸟的体内分离到了一株病毒(见图:透射电镜),现苦于不知如何鉴定。老师说从电镜照片上观察,像是呼肠孤病毒属的病毒。我搞了三对禽呼肠孤的引物,P了几次都没P出来。现在想针对整个呼肠孤病毒属的保守序列设计引物做PCR,然后送去测序,针对结果设计引物再p,反复多次最后得到整个病毒的序列,再做blast。
现在想知道如和查找某一病毒属的保守序列,针对这个序列设计引物。还有我上面说的测病毒的全序列的想法是否可行。刚接触病毒,望大侠多多关照!

如何设计针对某一病毒属的引物?
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fudan671

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
做一个反转录,测序就可以了
2楼2016-02-24 09:44:22
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至繁归于至简

新虫 (正式写手)

你拿一堆这个属的病毒的已知序列比对下,看看高度保守区

发自小木虫Android客户端
3楼2016-02-24 14:20:32
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