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370921happy

金虫 (小有名气)

[求助] 镰刀菌鉴定 已有1人参与

小弟在做镰刀菌筛选鉴定的工作,已分离得到一百多株菌株(单孢分离),进行了ITS测序。现在想构建一个系统发育树(把序列放在一个树上)说明它们的亲缘关系,应该如何挑选相似的序列,选多少个比较合适。求指导
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zengsihai

木虫 (小有名气)

iloveemuch

【答案】应助回帖

请问,有从大豆中分离到的吗?
我的建议是:将所有测序到的在CLUSTALX进行ALIGN,定出一个基准的序列,然后,进行排队。一般重要的选取3个就可以,不重要的1个足够了。
zengsihai
2楼2014-09-12 22:35:17
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