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金虫 (小有名气)

[求助] 镰刀菌鉴定已有1人参与

小弟在做镰刀菌筛选鉴定的工作，已分离得到一百多株菌株（单孢分离），进行了ITS测序。现在想构建一个系统发育树（把序列放在一个树上）说明它们的亲缘关系，应该如何挑选相似的序列，选多少个比较合适。求指导

1楼 2013-10-14 22:59:59

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木虫 (小有名气)

iloveemuch

请问，有从大豆中分离到的吗？
我的建议是：将所有测序到的在CLUSTALX进行ALIGN,定出一个基准的序列，然后，进行排队。一般重要的选取3个就可以，不重要的1个足够了。

zengsihai

2楼2014-09-12 22:35:17

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