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ShawnXu1986新虫 (初入文坛)
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[交流]
水分子模拟，如何解决由于正负电荷点过于靠近导致的平均动能过大问题？
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各位前辈，大家好。 小弟自己写了个水分子模拟程序，NVE ensemble，使用了TIP3P, TIP5P水分子模型。在计算库仑力时使用的是Ewald summation。 在这两个模型中，正电荷位于Ｈ原子上，负电荷位于Ｏ原子上或者Ｍ site上。当O 原子和Ｈ原子特别靠近时，由于正负电荷吸引，库仑力会使得这两个原子靠近，但越靠近库仑力越大，则两个原子更加靠近！！ 由于LJ势能只应用在O-O 原子之间，所以没有排斥力使得这一对ＯＨ原子分开，这两种原子只能由极高的速度逃脱彼此，避免碰撞在一起。 但这就导致了整个系统的平均动能变得非常大，使得模拟的温度不合常理的高（大于10000Ｋ）。 我想到的一个办法是在每一步都对速度进行等比缩小，使得系统平均动能给出的温度能够靠近我想要的温度（比如300K）。但这个办法并不可行。因为两个电荷点避免碰撞在一起需要两个电荷点有较高的速度，如果没有速度，那么这两个电荷就最终重叠到一起了，使得计算崩溃。 请各位能够帮帮我，支出我的理解是否有误，并请给我指出正确的方向，非常感谢  |
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