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ShawnXu1986

新虫 (初入文坛)

[交流] 水分子模拟,如何解决由于正负电荷点过于靠近导致的平均动能过大问题?

各位前辈,大家好。

小弟自己写了个水分子模拟程序,NVE ensemble,使用了TIP3P, TIP5P水分子模型。在计算库仑力时使用的是Ewald summation。

在这两个模型中,正电荷位于H原子上,负电荷位于O原子上或者M site上。当O 原子和H原子特别靠近时,由于正负电荷吸引,库仑力会使得这两个原子靠近,但越靠近库仑力越大,则两个原子更加靠近!! 由于LJ势能只应用在O-O 原子之间,所以没有排斥力使得这一对OH原子分开,这两种原子只能由极高的速度逃脱彼此,避免碰撞在一起。

但这就导致了整个系统的平均动能变得非常大,使得模拟的温度不合常理的高(大于10000K)。 

我想到的一个办法是在每一步都对速度进行等比缩小,使得系统平均动能给出的温度能够靠近我想要的温度(比如300K)。但这个办法并不可行。因为两个电荷点避免碰撞在一起需要两个电荷点有较高的速度,如果没有速度,那么这两个电荷就最终重叠到一起了,使得计算崩溃。

请各位能够帮帮我,支出我的理解是否有误,并请给我指出正确的方向,非常感谢
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Ninazizi

新虫 (初入文坛)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
加上O-H作用的LJ势。。。。
6楼2015-12-17 15:48:26
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mzhyan

至尊木虫 (文坛精英)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
还是祝福吧,呵呵呵呵呵呵呵呵呵呵。
3楼2015-12-14 13:56:38
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luojing1336

银虫 (初入文坛)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
可以考虑使用 速度-温度修正公式
5楼2015-12-17 12:59:39
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jerkwin

专家顾问 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
我怀疑你使用的势函数不对, 一般使用这两个水模型时都是刚性的, 而且不会出现你说的那种情况. 建议你仔细检查先所用的参数对不对. 是不是单位弄错了.
7楼2015-12-18 12:24:21
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