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Mingle_Su

银虫 (小有名气)

[求助] CoIP/蛋白互作|| 阴性对照杂出条带 ||FLAG HA Triton 洗涤 原生质体瞬时表达已有2人参与

阴性对照的也被沉淀下来了,一周的实验就这样废了,请各位资深朋友帮分析下原因。每个样品用了20ul带FLAG抗体的磁珠(sigma),孵育结合后用0.1%的Triton 100 洗涤4次,最后用50mM的Tris-HCl pH=7.5 洗涤,每次洗涤均用1mL的buffer。个人觉得应该不是珠子没洗干净,另外考虑蛋白直接结合磁珠,两个完全不相关的蛋白都可以结合磁珠更加不可能。只能想到以上两个比较直接原因,请各位高手指教。 具体问题见下图,谢谢!

CoIP/蛋白互作|| 阴性对照杂出条带 ||FLAG HA Triton 洗涤 原生质体瞬时表达
CoIP
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mofashishe

铜虫 (小有名气)

用结合ha的凝胶,还有你是不是把抗体搞错了啊。

发自小木虫Android客户端
8楼2015-12-13 23:01:29
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陈爱中

新虫 (小有名气)

反正你都过表达的,为什么不直接做体外pull-down?
2楼2015-12-13 11:19:35
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mofashishe

铜虫 (小有名气)

e81那个样品和flag抗体有交叉反应?

发自小木虫Android客户端
3楼2015-12-13 11:37:54
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Mingle_Su

银虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 陈爱中 at 2015-12-13 11:19:35
反正你都过表达的,为什么不直接做体外pull-down?

原生质体过表达和原核过表达差挺多的。其实我同时在做酵母双杂交,BiFC 和共定位的实验,哈哈。
Succeed
4楼2015-12-13 13:32:07
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Mingle_Su

银虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by mofashishe at 2015-12-13 11:37:54
e81那个样品和flag抗体有交叉反应?

E81 和 E9 算是两个独立的实验,都出现了同样的问题,交叉反应的可能性应该不大。
Succeed
5楼2015-12-13 13:36:18
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mofashishe

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by Mingle_Su at 2015-12-13 13:36:18
E81 和 E9 算是两个独立的实验,都出现了同样的问题,交叉反应的可能性应该不大。...

换一种凝胶试试了没?有没做过重复实验啊?从提提质粒开始,

发自小木虫Android客户端
6楼2015-12-13 14:30:38
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Mingle_Su

银虫 (小有名气)

引用回帖:
6楼: Originally posted by mofashishe at 2015-12-13 14:30:38
换一种凝胶试试了没?有没做过重复实验啊?从提提质粒开始,
...

正在准备重复,换种凝胶是指?谢谢。
Succeed
7楼2015-12-13 17:17:10
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mofashishe

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
8楼: Originally posted by mofashishe at 2015-12-13 23:01:29
用结合ha的凝胶,还有你是不是把抗体搞错了啊。

你是不是把ha和flag两个抗体弄混了,你上下两个图换换结果就很好了

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» 本帖已获得的红花(最新10朵)

9楼2015-12-13 23:03:10
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Mingle_Su

银虫 (小有名气)

送红花一朵
引用回帖:
9楼: Originally posted by mofashishe at 2015-12-13 23:03:10
你是不是把ha和flag两个抗体弄混了,你上下两个图换换结果就很好了
...

我也想像你描述的那样但真的用错没有,FLAG的珠子是黑色的磁珠,HA的珠子是白色的没有磁性的。而且FLAG标签的蛋白在IP后明显富集了。。。
Succeed
10楼2015-12-13 23:56:09
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