应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 微生物高通量测序
91/1返回列表
查看: 2172  |  回复: 8
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

音乐之声0921

银虫 (小有名气)

[求助] 微生物高通量测序 已有2人参与

亲们，高通量测序里都需要统一测序深度吗？公司统一测序度得标准为我7个样品里reads最小的那个样品10029，而我其他样品里最多的达到了105009，是最小的那个的10倍以上，这样计算的多样性结果可靠吗？还有我那个稀释曲线在统一测序深度的那个点能反映样本微生物的多样性吗   

微生物高通量测序
1.png


微生物高通量测序-1
2.png
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2015-11-20 16:19:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

czfscf

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
音乐之声0921: 金币+6, ★有帮助 2015-11-20 19:41:48
可以的 可以用。 但你应该有至少3个重复啊
赞一下(2人) 回复此楼
Ecological Genomics；the scientific walking hormone
2楼2015-11-20 18:47:12
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

great07225388

新虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
音乐之声0921: 金币+8, ★★★很有帮助 2015-11-20 19:42:00
这个涉及到数据的抽平的问题，数据抽不抽平不影响微生物群落结构，但是对样品群落丰富度评估的几个参数有影响。

发自小木虫Android客户端
赞一下(2人) 回复此楼
3楼2015-11-20 19:26:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

音乐之声0921

银虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by czfscf at 2015-11-20 18:47:12
可以的 可以用。 但你应该有至少3个重复啊

做的混样，没有做重复
赞一下 回复此楼
4楼2015-11-20 19:42:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

音乐之声0921

银虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by czfscf at 2015-11-20 18:47:12
可以的 可以用。 但你应该有至少3个重复啊

那我这个样品2,3的测序深度岂不是很小，度不能覆盖大部分微生物信息吧？
赞一下 回复此楼
5楼2015-11-20 19:46:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

音乐之声0921

银虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by great07225388 at 2015-11-20 19:26:38
这个涉及到数据的抽平的问题，数据抽不抽平不影响微生物群落结构，但是对样品群落丰富度评估的几个参数有影响。

那我这个样品2,3的测序深度岂不是很小，都不能覆盖大部分微生物信息吧？
赞一下 回复此楼
6楼2015-11-20 19:46:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

小飞虫haha

禁虫 (初入文坛)
本帖内容被屏蔽
7楼2015-11-20 22:07:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

czfscf

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
4楼: Originally posted by 音乐之声0921 at 2015-11-20 19:42:34
做的混样，没有做重复...

孩子 现在没有测序公司不建议混样的 也没有实验人敢不拿混样做的 要不然数据差异太大 但即便是混样 也必须有生物学重复 要不然这样的数据是没有发表的
赞一下(1人) 回复此楼
Ecological Genomics；the scientific walking hormone
8楼2015-11-25 18:18:23
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

当陌路放歌

铜虫 (小有名气)
至少三个生物学重复 最好再来三个技术重复 看看差异性显著不

发自小木虫IOS客户端
赞一下 回复此楼
9楼2015-11-25 23:44:18
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 音乐之声0921 的主题更新
91/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[公派出国] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 YXM1FDCSE8Bn 2026-10-31 7/350 2026-11-02 12:46 by n0P4fnsXKbBK
[考研] 售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +3 YXM1FDCSE8Bn 2026-10-31 6/300 2026-11-02 12:44 by n0P4fnsXKbBK
[找工作] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 YXM1FDCSE8Bn 2026-11-01 6/300 2026-11-02 10:02 by dcc2yOIRGGTT
[公派出国] 售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急 +3 YXM1FDCSE8Bn 2026-11-01 6/300 2026-11-02 09:57 by dcc2yOIRGGTT
[找工作] 售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急 +3 YXM1FDCSE8Bn 2026-10-31 5/250 2026-11-02 09:42 by dcc2yOIRGGTT
[博后之家] 售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +4 hKe7U1kad5Sg 2026-10-31 7/350 2026-11-02 09:29 by dcc2yOIRGGTT
[硕博家园] 售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急 +3 hKe7U1kad5Sg 2026-10-31 7/350 2026-11-02 06:29 by xzcv0Tehd8lQ
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +4 xvJS1BYDxvBS 2026-10-31 8/400 2026-11-02 06:13 by xzcv0Tehd8lQ
[硕博家园] 售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +4 hKe7U1kad5Sg 2026-10-31 9/450 2026-11-02 06:13 by xzcv0Tehd8lQ
[公派出国] 售SCI文章，我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 xvJS1BYDxvBS 2026-10-31 8/400 2026-11-02 06:07 by xzcv0Tehd8lQ
[论文投稿] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 1uaZt2kAZj2S 2026-10-30 14/700 2026-11-02 05:41 by xzcv0Tehd8lQ
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +6 X5bHxOULxFqb 2026-10-30 16/800 2026-11-02 02:34 by xzcv0Tehd8lQ
[考博] 售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +3 hKe7U1kad5Sg 2026-10-31 6/300 2026-11-01 22:11 by xzcv0Tehd8lQ
[考研] 售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急 +3 hKe7U1kad5Sg 2026-10-31 6/300 2026-11-01 19:50 by xzcv0Tehd8lQ
[公派出国] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +4 1uaZt2kAZj2S 2026-10-30 15/750 2026-11-01 16:52 by BCdvBAEpt3zm
[找工作] 售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +4 1uaZt2kAZj2S 2026-10-31 8/400 2026-11-01 14:48 by BCdvBAEpt3zm
[考研] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +3 xvJS1BYDxvBS 2026-10-31 5/250 2026-11-01 12:51 by BCdvBAEpt3zm
[考博] 售SCI文章，我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 1uaZt2kAZj2S 2026-10-30 10/500 2026-11-01 12:27 by BCdvBAEpt3zm
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +4 X5bHxOULxFqb 2026-10-30 18/900 2026-11-01 12:11 by BCdvBAEpt3zm
[硕博家园] 申博自荐 2篇一区TOP+1篇EI+2公开发明专利 2027博士申请 +3 小小阿光 2026-10-27 3/150 2026-10-29 23:56 by 起风了的快乐
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭