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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 分类/鉴定 » 土壤微生物高通量测序需不需要做生物学重复
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feifei0826

新虫 (初入文坛)

[求助] 土壤微生物高通量测序需不需要做生物学重复 已有5人参与

现需要做高通量测序，但由于样品太多，考虑要不做重复，请求大神指教

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
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1楼 2015-07-02 23:17:52
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Breeze_liang

新虫 (正式写手)
这样根据你的采样情况和实验要求来考虑吧
还有就是，要是在公司测，费用也得考虑吧
所以，再给点信息，大家一起看看
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2楼2015-07-03 08:37:15
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bueapple

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
我最近也在做这个，由于样品比较多，所以没有做重复，只是将生物学重复样品的DNA提取之后进行等量混合，再测序的
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静而后能安，安而后能虑，虑而后能得！
3楼2015-07-04 19:58:18
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肥猫p

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
听过一个讲座，严格来说，需要三个重复。不够这样确实费用太贵了。
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4楼2015-07-04 22:29:43
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kiruwa

专家顾问 (职业作家)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
引用回帖:
3楼: Originally posted by bueapple at 2015-07-04 19:58:18
我最近也在做这个，由于样品比较多，所以没有做重复，只是将生物学重复样品的DNA提取之后进行等量混合，再测序的

我也是这么做的。重复没有太大意义。
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请注意,照片不是我本人!!!请不要把此人和我的长相联系到一起去.
5楼2015-07-05 11:17:30
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snoopytbw

荣誉版主 (著名写手)

【答案】应助回帖

测序不需要重复的，而且做重复没有意义，因为测序本身具有一定的检错率，重复的意义在于尽可能的减少人为误差，你可以前处理多做几组，然后混合提核酸。另外，咨询下做宏基因组学是跟哪家公司合作的，是不是华大基因啊，大概要多少经费，我也想做呢
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6楼2015-07-06 08:48:21
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great07225388

新虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

重复理论上来说是要有的，但是不是一定要有。重复分为生物学重复和实验重复，生物学重复是为了消除个体差异，例如楼主在同一条件下的重复取样。本来微生物多样性就是研究统计学意义，如果没了重复，说服力将大打折扣。但是在样本量特别大或者其他的条件下，重复又可以避免。实验重复是为了避免在实验过程中的人为操作误差和仪器误差，具体操作包括做平行实验，设置阴阳性对照等等，这两类重复是不同的重复，需要区别对待。

[ 发自小木虫客户端 ]
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7楼2015-07-14 09:52:52
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