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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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yxl4390

新虫 (初入文坛)

[求助] 土壤微生物做高通量测序一般需要测几个样品? 已有3人参与

各位大侠好,我想做土壤微生物多样性研究,想直接用高通量测序进行土壤样品分析,我现在不明白一般土壤样品需要测几个才合理?我采了很多平行的土壤样品,混合后就测一个这样可以吗?请指教。
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新手上路,请多指教。
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happy6

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
如果经费允许的话,最好设置生物学重复,供参考。
2楼2016-01-20 09:12:09
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beibeihu113

新虫 (初入文坛)

如果经费充足的话,建议至少测3个平行。但现实中由于经费问题,好多文献都是3个或3个以上样品混合后,进行高通量测序。
专注微生物生态学研究 QQ2758452825 微基生物 400-660-9270
3楼2016-02-15 14:00:19
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jackyoung

新虫 (正式写手)

有没有处理/对照?或者组内/组间?考虑相应的重复

发自小木虫Android客户端
CestLaVie
4楼2016-02-15 23:48:45
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KOP利

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

做微生物多样性测序应设置生物学重复(至少3重复),几位楼上是误会楼主要做宏基因组测序了吧?做微生物多样性测序应该选用16s rRNA测序法即可,这个我15年9月份做过,价格为800元/样本,做3万条tags.
YNWA!
5楼2016-02-16 08:42:50
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mao081312

铁虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

微生物多样性如果进行分组比较,每个组至少设置三个生物学重复,但是每个样本可以根据一定的采样方法进行混样
6楼2016-02-20 18:15:19
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KOP利

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

16s rRNA测序实验,要做生物学重复才有统计学意义,至少做3组样本。我2周前做的16s 测序实验,700元/样本,老板也觉得很便宜。
YNWA!
7楼2016-03-03 16:27:45
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崔士元

金虫 (正式写手)

引用回帖:
5楼: Originally posted by KOP利 at 2016-02-16 08:42:50
做微生物多样性测序应设置生物学重复(至少3重复),几位楼上是误会楼主要做宏基因组测序了吧?做微生物多样性测序应该选用16s rRNA测序法即可,这个我15年9月份做过,价格为800元/样本,做3万条tags.

在哪儿做的

发自小木虫IOS客户端
男人,就要对自己狠一点!
8楼2016-03-03 18:56:47
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KOP利

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

引用回帖:
8楼: Originally posted by 崔士元 at 2016-03-03 18:56:47
在哪儿做的
...

我是上海这边的,在上海英拜生物科技有限公司做的。当时是700元/样本,我们实验室做了50个细菌样本。
YNWA!
9楼2016-03-04 08:43:21
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KOP利

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

微生物多样性研究没多少钱的,就每个样本700元左右。你何不做几十个样本呢,这样既有生物学重复又超不过经费预算。得出来的数据可以直接拿来写文章。多好。我师姐刚跟上海的一家公司签了70个样本的16s 测序实验,每个样本才600元,老板给的经费是8万元。。。。今年师姐毕业。
YNWA!
10楼2016-03-23 16:55:58
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