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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 分子生理 » 土壤微生物做高通量测序一般需要测几个样品？
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yxl4390

新虫 (初入文坛)

[求助] 土壤微生物做高通量测序一般需要测几个样品？ 已有3人参与

各位大侠好，我想做土壤微生物多样性研究，想直接用高通量测序进行土壤样品分析，我现在不明白一般土壤样品需要测几个才合理？我采了很多平行的土壤样品，混合后就测一个这样可以吗？请指教。
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新手上路，请多指教。
1楼 2016-01-19 15:40:49
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KOP利

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

做微生物多样性测序应设置生物学重复（至少3重复），几位楼上是误会楼主要做宏基因组测序了吧？做微生物多样性测序应该选用16s rRNA测序法即可，这个我15年9月份做过，价格为800元/样本，做3万条tags.
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YNWA！
5楼2016-02-16 08:42:50
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happy6

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
如果经费允许的话，最好设置生物学重复，供参考。
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2楼2016-01-20 09:12:09
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beibeihu113

新虫 (初入文坛)
如果经费充足的话，建议至少测3个平行。但现实中由于经费问题，好多文献都是3个或3个以上样品混合后，进行高通量测序。
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专注微生物生态学研究 QQ2758452825 微基生物 400-660-9270
3楼2016-02-15 14:00:19
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jackyoung

新虫 (正式写手)
有没有处理/对照？或者组内/组间？考虑相应的重复

发自小木虫Android客户端
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CestLaVie
4楼2016-02-15 23:48:45
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