24小时热门版块排行榜    

查看: 7101  |  回复: 9
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

yxl4390

新虫 (初入文坛)

[求助] 土壤微生物做高通量测序一般需要测几个样品? 已有3人参与

各位大侠好,我想做土壤微生物多样性研究,想直接用高通量测序进行土壤样品分析,我现在不明白一般土壤样品需要测几个才合理?我采了很多平行的土壤样品,混合后就测一个这样可以吗?请指教。
回复此楼
新手上路,请多指教。
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

KOP利

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

做微生物多样性测序应设置生物学重复(至少3重复),几位楼上是误会楼主要做宏基因组测序了吧?做微生物多样性测序应该选用16s rRNA测序法即可,这个我15年9月份做过,价格为800元/样本,做3万条tags.
YNWA!
5楼2016-02-16 08:42:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 10 个回答

happy6

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
如果经费允许的话,最好设置生物学重复,供参考。
2楼2016-01-20 09:12:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

beibeihu113

新虫 (初入文坛)

如果经费充足的话,建议至少测3个平行。但现实中由于经费问题,好多文献都是3个或3个以上样品混合后,进行高通量测序。
专注微生物生态学研究 QQ2758452825 微基生物 400-660-9270
3楼2016-02-15 14:00:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jackyoung

新虫 (正式写手)

有没有处理/对照?或者组内/组间?考虑相应的重复

发自小木虫Android客户端
CestLaVie
4楼2016-02-15 23:48:45
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
信息提示
请填处理意见