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微生物高通量测序已有2人参与
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亲们，高通量测序里都需要统一测序深度吗？公司统一测序度得标准为我7个样品里reads最小的那个样品10029，而我其他样品里最多的达到了105009，是最小的那个的10倍以上，这样计算的多样性结果可靠吗？还有我那个稀释曲线在统一测序深度的那个点能反映样本微生物的多样性吗   1.png  2.png |
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2楼2015-11-20 18:47:12
great07225388
新虫 (著名写手)
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【答案】应助回帖
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感谢参与，应助指数 +1
音乐之声0921: 金币+8, ★★★很有帮助 2015-11-20 19:42:00
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这个涉及到数据的抽平的问题，数据抽不抽平不影响微生物群落结构，但是对样品群落丰富度评估的几个参数有影响。 发自小木虫Android客户端 |
3楼2015-11-20 19:26:38
4楼2015-11-20 19:42:34
5楼2015-11-20 19:46:02
6楼2015-11-20 19:46:15
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7楼2015-11-20 22:07:50
8楼2015-11-25 18:18:23
9楼2015-11-25 23:44:18