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changmaster新虫 (小有名气)
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高通量测序后分析相关 已有4人参与
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| 在诺禾做的转录组测序，总共4个样，一个对照，3个不同时间的处理样。对材料进行3h，6h，9h的胁迫处理，获得的3个处理样。看文献好像大多数学者都把不同时间的处理样进行混合，然后测序，最后只需要分析处理样跟对照两个进行比较。我当初测序的时候不懂，听了公司销售人员的话（多测钱多），没有混合，导致现在不知道该怎么分析。请问有没有哪位大侠可以给点建议的，感激不尽！ |
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【答案】应助回帖
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西门吹雪170: 金币+2, 鼓励回帖交流 2015-10-19 22:59:14
西门吹雪170: 金币+2, 鼓励回帖交流 2015-10-19 22:59:14
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这其实是测序公司没有跟你说清楚，或者想让你多测几个样。一般来说，测序分析就是两组进行比对。你的时间点本是预实验该做的事情，通过预实验，找到最合适的一个时间点，然后做测序，分析。 既然已经测了，说责备谁的话也没用。建议你分析一下3个时间点的数据与对照组的差异，选择差异最大的一个进行详细分析。如此即可！ 如果还有什么不懂，欢迎私信。 |
changmaster8楼2015-10-17 23:42:03
yuanuancao
木虫 (小有名气)
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【答案】应助回帖
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感谢参与，应助指数 +1
西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2015-10-19 22:58:41
感谢参与，应助指数 +1
西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2015-10-19 22:58:41
| 可以分别分析对照与3个处理样的差异基因，以及对照与3个处理样共有的差异基因 |
» 本帖已获得的红花（最新10朵）
2楼2015-10-10 08:49:40
3楼2015-10-10 12:45:05
changmaster
新虫 (小有名气)
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4楼2015-10-10 16:53:50
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