应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 生物信息 » 怎样查找一个属的特有序列呢？求教高手！
52/1返回列表
查看: 2403  |  回复: 12
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

梦黎科研

金虫 (小有名气)

[求助] 怎样查找一个属的特有序列呢？求教高手！ 已有2人参与

在做假单胞菌属的分析，需要查找到假单胞菌属的特有基因序列，但是无从下手。
已在Goog学术，几web of science查过相关文章，大部分只是叙述了相关蛋白或功能基因，一来没有公开序列，二来也没有说明是否是该属特有的。
头疼中……
等待高手。
回复此楼

» 猜你喜欢
1楼 2015-09-29 11:48:41
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

happy笨笨蛋

新虫 (初入文坛)
楼主您好，请问您是怎么找假单胞菌属特有序列的

发自小木虫Android客户端
赞一下 回复此楼
13楼2018-06-22 00:18:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 13 个回答

品茗听雨0530

铁虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
在NCBI的nuleotide数据库中搜索假单胞菌属（英文名称）的序列。
赞一下 回复此楼
2楼2015-09-29 19:18:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

梦黎科研

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 品茗听雨0530 at 2015-09-29 19:18:20
在NCBI的nuleotide数据库中搜索假单胞菌属（英文名称）的序列。

能具体点吗？怎样拿到其特有序列呢？
最终目的，是今后在重新检测一个菌是否为该菌时，只用特有序列设计出来的引物扩增有条带即可。还请不吝赐教。

发自小木虫Android客户端
赞一下 回复此楼
3楼2015-09-30 23:38:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

品茗听雨0530

铁虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★
梦黎科研: 金币+1, ★有帮助 2015-10-02 21:16:45
引用回帖:
3楼: Originally posted by 梦黎科研 at 2015-09-30 23:38:13
能具体点吗？怎样拿到其特有序列呢？
最终目的，是今后在重新检测一个菌是否为该菌时，只用特有序列设计出来的引物扩增有条带即可。还请不吝赐教。
...

那你首先要通过查资料筛选某种细菌特有的基因，然后再设计这种基因的引物。你的想法很好，不过个人觉得你的目的很难实现，要想鉴定细菌还是要通过测序比较保险。
赞一下 回复此楼
4楼2015-10-01 10:23:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 13 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] FileCode能看出啥？ +8 要乐观耀哥 2026-08-10 23/1150 2026-08-13 00:35 by 要乐观耀哥
[基金申请] 应该是93bebmhtak前后十一个字符比较关键 +22 Lanmanbaby 2026-08-09 36/1800 2026-08-12 22:50 by sdfapple719
[基金申请] 关于Filecode分析方法 +8 majunge000 2026-08-10 9/450 2026-08-12 22:17 by 虫友是什么虫
[基金申请] 2019年青年基金涵评意见，大家看看几个A，几个B? +10 Tide man 2026-08-11 10/500 2026-08-12 20:59 by 陈晨晨陈啊
[基金申请] 好奇怪的filecode +5 布布和一二 2026-08-08 6/300 2026-08-12 16:11 by 云上清扬
[基金申请] filecode +13 documentary 2026-08-10 15/750 2026-08-12 15:56 by 云上清扬
[基金申请] 综述论文作为代表作会不会影响评审专家的印象分？ +11 yufeiwaner 2026-08-09 13/650 2026-08-12 08:17 by yufeiwaner
[基金申请] 有时候，自然基金真的不能太认真 （我的申报经验） +3 majunge000 2026-08-11 4/200 2026-08-11 20:13 by lch2012
[基金申请] 帮忙看看fileCode +7 wwncly 2026-08-10 13/650 2026-08-11 19:36 by 冰心玉壶晴
[硕博家园] 读博的好处 +3 lnee 2026-08-11 3/150 2026-08-11 18:10 by 希望我好好的
[基金申请] 分享一下我之前已中青C的计划书的filecode +3 布布和一二 2026-08-11 4/200 2026-08-11 15:20 by aasahr
[基金申请] 听说今天filecode变了 +26 布布和一二 2026-08-06 49/2450 2026-08-11 13:18 by WH3796
[基金申请] 基金中了 +15 laoda193707 2026-08-06 15/750 2026-08-11 00:11 by jiafei2190
[基金申请] 国自然结果 +4 Vierhys 2026-08-10 8/400 2026-08-10 15:06 by Vierhys
[基金申请] 据悉今年马上要出结果了 +7 瞬息宇宙 2026-08-10 8/400 2026-08-10 12:42 by Vivilian
[基金申请] 这样的filecode谁见过 +11 布布和一二 2026-08-08 22/1100 2026-08-10 11:10 by wmfsnow
[基金申请] fileCode有新解读？ +10 Tide man 2026-08-08 18/900 2026-08-09 12:55 by 仁砚薪传
[基金申请] 关于filecode，很负责任的告诉大家 +6 爱看书的可乐 2026-08-08 7/350 2026-08-08 22:13 by a_niu
[基金申请] 大家散了吧，后缀研究没有意义，别浪费时间了，过好目前的每一天，不要焦虑 +5 Tide man 2026-08-06 7/350 2026-08-07 13:11 by 医学老男孩
[基金申请] filecode +14 等待解的谜 2026-08-06 19/950 2026-08-07 12:20 by wlwhappy
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭