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loveming313

新虫 (小有名气)

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[交流] 请大家帮帮忙，这个PCR程序是什么意思？如何在PCR仪上设置？

请大家帮帮忙，这个PCR程序是什么意思？如何在PCR仪上设置？
1.这是属于跳跃PCR ,还是什么?
2.这种PCR用普通taq酶可以P吗？
3.在PCR仪上如何设置这个程序？
4.PCR程序中变性、退火、延伸的反应时间是怎么确定的？和哪些因素（如酶、扩增片段、模板）有关？

搜狗截图15年09月09日PCR程序.png

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Gaussian计算到这就算不下去了，怎么回事阿？已经有21人回复

1楼 2015-09-09 17:07:27

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枭翔

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引用回帖:

5楼: Originally posted by loveming313 at 2015-09-10 08:05:51
是的，第9部是28个循环
https://www2.jax.org/protocolsdb/f?p=116:2:0::NO:2

2_MASTER_PROTOCOL_ID,P2_JRS_CODE:10238,021302
是这个网站上的鉴定程序，

2.这种PCR用普通taq酶可以P吗？
3.在PCR仪上如何设 ...

第一个问题，可以用普通的rTaq酶。
第二个问题，不知道你们PCR仪器是哪个公司的，你可以看看说明书。
第三个问题，变性是根据你的酶设定的、退火温度是是根据你的引物TM确定的，延长时间是根据你扩增片段大小来确定的。
附加：为什么用touchdown呢？是因为当你不确定引物的最佳退火温度的时候，可以从65度向下降，当退火温度高的时候，只有特异性条带，退火温度依次降低，那么非特异性条带可能就会出现。这时候，前面10个降落循环中，PCR产物肯定会有你的特异性条带，所以第二个延伸28个循环，然后在某一个确定退火温度下，这时候引物就会以你的特异性条带结合，然后PCR结束以后，你的目的条带才是比较亮的。