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ly1171193313

新虫 (初入文坛)

[求助] linux系统下autodock4如何多核计算,以及gromacs里mdrun如何实现多核计算? 已有2人参与

各位大神,小弟最近遇到困难,linux系统下如何实现autodock4多核计算,linux命令是什么?设置几个核比较好?
而且gromacs如何实现多核计算,我输入mdrun -nt为什么不管用啊,设置几个核比较好?谢谢各位大哥了
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jinfan709

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

autodock不能并行,单线程

发自小木虫IOS客户端
7楼2015-09-18 13:58:29
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XYwinne

金虫 (小有名气)

我只知道多核运算的命令

发自小木虫Android客户端
2楼2015-09-15 10:45:08
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aileen2010

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

gromacs默认安装的就是多线程的版本 也就是自动分配多核计算 前提是机器是多核的 自动分配的话会根据体系的大小来确定线程的多少
另 如果是MPI并行 则要安装MPI并行版gromacs
3楼2015-09-15 20:26:50
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ly1171193313

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by XYwinne at 2015-09-15 10:45:08
我只知道多核运算的命令

大哥,gromacs的我知道了,现在不知道autodock如何实现多核运算,大哥,你知道命令吗?
谢谢
4楼2015-09-17 10:07:21
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