应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » linux系统下autodock4如何多核计算，以及gromacs里mdrun如何实现多核计算？
北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
71/1返回列表
查看: 1552  |  回复: 6
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

ly1171193313

新虫 (初入文坛)

[求助] linux系统下autodock4如何多核计算，以及gromacs里mdrun如何实现多核计算？ 已有2人参与

各位大神，小弟最近遇到困难，linux系统下如何实现autodock4多核计算，linux命令是什么？设置几个核比较好？
而且gromacs如何实现多核计算，我输入mdrun -nt为什么不管用啊，设置几个核比较好？谢谢各位大哥了
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2015-09-08 21:00:27
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

XYwinne

金虫 (小有名气)
我只知道多核运算的命令

发自小木虫Android客户端
赞一下 回复此楼
2楼2015-09-15 10:45:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

aileen2010

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

gromacs默认安装的就是多线程的版本 也就是自动分配多核计算 前提是机器是多核的 自动分配的话会根据体系的大小来确定线程的多少
另 如果是MPI并行 则要安装MPI并行版gromacs
赞一下 回复此楼
3楼2015-09-15 20:26:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ly1171193313

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by XYwinne at 2015-09-15 10:45:08
我只知道多核运算的命令

大哥，gromacs的我知道了，现在不知道autodock如何实现多核运算，大哥，你知道命令吗？
谢谢
赞一下 回复此楼
4楼2015-09-17 10:07:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ly1171193313

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
3楼: Originally posted by aileen2010 at 2015-09-15 20:26:50
gromacs默认安装的就是多线程的版本 也就是自动分配多核计算 前提是机器是多核的 自动分配的话会根据体系的大小来确定线程的多少
另 如果是MPI并行 则要安装MPI并行版gromacs

大哥，gromacs的我知道了，现在不知道autodock如何实现多核运算，大哥，你知道命令吗？
谢谢
赞一下 回复此楼
5楼2015-09-17 10:07:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

XYwinne

金虫 (小有名气)
引用回帖:
5楼: Originally posted by ly1171193313 at 2015-09-17 10:07:42
大哥，gromacs的我知道了，现在不知道autodock如何实现多核运算，大哥，你知道命令吗？
谢谢...

不好意思，没用过autodock。

发自小木虫Android客户端
赞一下(1人) 回复此楼
6楼2015-09-17 13:52:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jinfan709

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

autodock不能并行，单线程

发自小木虫IOS客户端
赞一下 回复此楼
7楼2015-09-18 13:58:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 ly1171193313 的主题更新
71/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 调剂推荐 +7 清酒714 2026-03-26 8/400 2026-03-31 22:12 by 544594351
[考研] 一志愿南师大0703化学 275求调剂 +5 Ripcord上岸 2026-03-27 5/250 2026-03-31 19:52 by mg1014
[考研] 省双一流重点一本大学招收调剂 +3 wwwwffffff 2026-03-31 5/250 2026-03-31 19:49 by 曾曾曾！
[考研] 复试调剂 +7 双马尾痞老板2 2026-03-31 7/350 2026-03-31 19:49 by Dyhoer
[考研] 化学308分调剂 +11 你好明天你好 2026-03-30 12/600 2026-03-31 19:14 by 杨金金金
[考研] 375求调剂 +7 雨夏整夜 2026-03-29 7/350 2026-03-31 18:52 by xhai2011
[考研] 299求调剂 +8 嗯嗯嗯嗯2 2026-03-27 8/400 2026-03-31 18:23 by lizhi8172
[考研] 263求调剂 +3 DDDDuu 2026-03-27 3/150 2026-03-31 16:21 by 土木硕士招生
[考研] 调剂求院校招收 +7 鹤鲸鸽 2026-03-28 7/350 2026-03-31 11:21 by oooqiao
[考研] 262求调剂 +7 ZZ..000 2026-03-30 8/400 2026-03-31 10:05 by cal0306
[考研] 一志愿华中师范化学332分求调剂 +3 Lyy930824@ 2026-03-29 3/150 2026-03-30 20:15 by DHUSHUAI
[考研] 329求调剂 +10 钮恩雪 2026-03-25 10/500 2026-03-29 13:32 by peike
[考研] 081200-314 +3 LILIQQ 2026-03-27 4/200 2026-03-28 09:41 by 保护地球你我做�
[考研] 315分求调剂 +7 26考研上岸版26 2026-03-26 7/350 2026-03-28 04:05 by fmesaito
[考研] 352分 化工与材料 +5 海纳百川Ly 2026-03-27 5/250 2026-03-28 03:39 by fmesaito
[考研] 0703化学求调剂，各位老师看看我！！！ +5 祁祺祺 2026-03-25 5/250 2026-03-27 21:44 by 东方猪猪
[有机交流] 高温高压反应求助 10+4 chibby 2026-03-25 4/200 2026-03-27 21:08 by BT20230424
[考研] 调剂 +3 李嘉图·S·路 2026-03-27 3/150 2026-03-27 11:19 by wangjy2002
[硕博家园] 北京林业大学硕导招生广告 +6 kongweilin 2026-03-26 8/400 2026-03-27 10:18 by FF_16
[考研] 347求调剂 +4 L when 2026-03-25 4/200 2026-03-25 13:37 by cocolv
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭