应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » linux系统下autodock4如何多核计算，以及gromacs里mdrun如何实现多核计算？
51/1返回列表
查看: 1680  |  回复: 6
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

ly1171193313

新虫 (初入文坛)

[求助] linux系统下autodock4如何多核计算，以及gromacs里mdrun如何实现多核计算？ 已有2人参与

各位大神，小弟最近遇到困难，linux系统下如何实现autodock4多核计算，linux命令是什么？设置几个核比较好？
而且gromacs如何实现多核计算，我输入mdrun -nt为什么不管用啊，设置几个核比较好？谢谢各位大哥了
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2015-09-08 21:00:27
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

aileen2010

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

gromacs默认安装的就是多线程的版本 也就是自动分配多核计算 前提是机器是多核的 自动分配的话会根据体系的大小来确定线程的多少
另 如果是MPI并行 则要安装MPI并行版gromacs
赞一下 回复此楼
3楼2015-09-15 20:26:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 7 个回答

XYwinne

金虫 (小有名气)
我只知道多核运算的命令

发自小木虫Android客户端
赞一下 回复此楼
2楼2015-09-15 10:45:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ly1171193313

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by XYwinne at 2015-09-15 10:45:08
我只知道多核运算的命令

大哥，gromacs的我知道了，现在不知道autodock如何实现多核运算，大哥，你知道命令吗？
谢谢
赞一下 回复此楼
4楼2015-09-17 10:07:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ly1171193313

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
3楼: Originally posted by aileen2010 at 2015-09-15 20:26:50
gromacs默认安装的就是多线程的版本 也就是自动分配多核计算 前提是机器是多核的 自动分配的话会根据体系的大小来确定线程的多少
另 如果是MPI并行 则要安装MPI并行版gromacs

大哥，gromacs的我知道了，现在不知道autodock如何实现多核运算，大哥，你知道命令吗？
谢谢
赞一下 回复此楼
5楼2015-09-17 10:07:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 7 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +4 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 10/500 2026-08-29 16:49 by zICmwzsBXjbN
[公派出国] 售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +3 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 5/250 2026-08-29 14:23 by jCd0dEvKHShX
[论文投稿] 售SCI一区文章，我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +3 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 4/200 2026-08-29 14:13 by jCd0dEvKHShX
[公派出国] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +3 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 4/200 2026-08-29 14:02 by jCd0dEvKHShX
[找工作] 售SCI文章，我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 6/300 2026-08-29 11:51 by jCd0dEvKHShX
[教师之家] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +4 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 5/250 2026-08-29 11:49 by jCd0dEvKHShX
[考研] 售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急 +4 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 6/300 2026-08-29 11:40 by jCd0dEvKHShX
[考研] 售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +6 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 9/450 2026-08-29 11:18 by jCd0dEvKHShX
[基金申请] 国自然面上复盘~欢迎讨论 (金币+15) +14 晴天加油 2026-08-26 15/750 2026-08-29 11:06 by biily
[基金申请] 中青基了要发朋友圈吗？ +3 349506619 2026-08-28 3/150 2026-08-29 10:49 by 木风9012
[基金申请] 国自然评审意见 +13 wangmingqi 2026-08-28 19/950 2026-08-29 10:22 by Poppy1104
[基金申请] 我就是申请一个面上项目而已，这评审意见是按照杰青的条件评的吧？ +6 gouxfjh 2026-08-28 9/450 2026-08-29 09:59 by jklily
[教师之家] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 7/350 2026-08-29 09:26 by G6APbkg8SA6w
[基金申请] 2026年叶企孙基金 +4 bud_bud 2026-08-27 7/350 2026-08-29 07:23 by foolishmani
[基金申请] 基金不中，共勉 +11 eulota 2026-08-26 11/550 2026-08-28 14:22 by 火星超人xi
[基金申请] 申请删除本帖 +6 lyz123lyz 2026-08-27 7/350 2026-08-27 17:31 by 宁静致远sy
[基金申请] 我不理解！ +15 Edward_pc 2026-08-26 23/1150 2026-08-26 20:34 by zzuzxg
[基金申请] 2026年8月25日国自然放榜前突然收到列入评审专家邮件，有关系吗？ +25 木水思豆 2026-08-25 28/1400 2026-08-26 14:53 by draco1987
[基金申请] 出来了 +9 trojank 2026-08-26 9/450 2026-08-26 14:25 by 宝贝虫子
[基金申请] 为什么国自然不能直接公布 +4 bjdxyxy 2026-08-26 4/200 2026-08-26 13:12 by qingmu1201
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭