应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » linux系统下autodock4如何多核计算，以及gromacs里mdrun如何实现多核计算？
北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
51/1返回列表
查看: 1554  |  回复: 6
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

ly1171193313

版主

优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！

[求助] linux系统下autodock4如何多核计算，以及gromacs里mdrun如何实现多核计算？ 已有2人参与

各位大神，小弟最近遇到困难，linux系统下如何实现autodock4多核计算，linux命令是什么？设置几个核比较好？
而且gromacs如何实现多核计算，我输入mdrun -nt为什么不管用啊，设置几个核比较好？谢谢各位大哥了
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2015-09-08 21:00:27
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

aileen2010

兑换贵宾

优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！

【答案】应助回帖

gromacs默认安装的就是多线程的版本 也就是自动分配多核计算 前提是机器是多核的 自动分配的话会根据体系的大小来确定线程的多少
另 如果是MPI并行 则要安装MPI并行版gromacs
赞一下 回复此楼
3楼2015-09-15 20:26:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 7 个回答

XYwinne

主管区长

优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！
我只知道多核运算的命令

发自小木虫Android客户端
赞一下 回复此楼
2楼2015-09-15 10:45:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ly1171193313

主管区长

优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！
引用回帖:
2楼: Originally posted by XYwinne at 2015-09-15 10:45:08
我只知道多核运算的命令

大哥，gromacs的我知道了，现在不知道autodock如何实现多核运算，大哥，你知道命令吗？
谢谢
赞一下 回复此楼
4楼2015-09-17 10:07:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ly1171193313

专家顾问

优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！
引用回帖:
3楼: Originally posted by aileen2010 at 2015-09-15 20:26:50
gromacs默认安装的就是多线程的版本 也就是自动分配多核计算 前提是机器是多核的 自动分配的话会根据体系的大小来确定线程的多少
另 如果是MPI并行 则要安装MPI并行版gromacs

大哥，gromacs的我知道了，现在不知道autodock如何实现多核运算，大哥，你知道命令吗？
谢谢
赞一下 回复此楼
5楼2015-09-17 10:07:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 7 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 085600 一志愿9 总分351 求调剂学校 +7 czhcz 2026-03-31 7/350 2026-03-31 18:54 by 小张做实验
[考研] 311求调剂一志愿合肥工业大学 +11 秋二十二 2026-03-30 11/550 2026-03-31 18:09 by 253863592
[考研] 285求调剂 +6 AZMK 2026-03-30 11/550 2026-03-31 17:33 by AZMK
[考研] 机械学硕总分317求调剂！！！！ +6 Acaciad 2026-03-25 6/300 2026-03-31 16:52 by asdfzly
[考研] 340求调剂 +4 希望如此i 2026-03-31 4/200 2026-03-31 16:40 by 690616278
[考研] 322求调剂 +3 熹僖XX 2026-03-31 3/150 2026-03-31 16:32 by 记事本2026
[考研] 材料工程专硕求调剂 +10 hyl3153942 2026-03-29 10/500 2026-03-31 16:31 by hypershenger
[考研] 一志愿武汉理工，总分321，英一数二，求老师收留。 +12 nnnnnnn5 2026-03-25 12/600 2026-03-31 16:21 by 记事本2026
[考研] 土木304求调剂 +4 兔突突突， 2026-03-31 5/250 2026-03-31 11:29 by 北风之神.
[考研] 276求调剂 +3 赵久华 2026-03-29 3/150 2026-03-31 10:06 by cal0306
[考研] 293分求调剂，外语为俄语 +5 加一一九 2026-03-31 5/250 2026-03-31 09:39 by zhshch
[考研] 哈尔滨工业大学材料与化工专硕378求调剂 +3 塔比乌斯 2026-03-30 3/150 2026-03-30 22:55 by 无际的草原
[考研] 332求调剂 +14 032500 2026-03-25 14/700 2026-03-30 20:03 by 无际的草原
[有机交流] 考研调剂 +8 watb 2026-03-26 8/400 2026-03-30 18:40 by 544594351
[考研] 334分 一志愿武理 材料求调剂 +16 李李不服输 2026-03-26 16/800 2026-03-30 17:47 by wangjy2002
[考研] 071010 323 分求调剂 +3 Baekzhy 2026-03-27 3/150 2026-03-30 14:24 by andresqi
[考研] 086000生物与医药调剂 +5 Feisty。 2026-03-28 9/450 2026-03-29 12:02 by longlotian
[考研] 283求调剂 +7 A child 2026-03-28 7/350 2026-03-28 12:05 by zllcz
[考研] 0703化学338求调剂！ +6 Zuhui0306 2026-03-26 7/350 2026-03-27 10:35 by shangxh
[考研] 302求调剂 +4 锦衣卫藤椒 2026-03-25 4/200 2026-03-25 16:29 by 功夫疯狂
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭