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小小雨儿飞

新虫 (初入文坛)

[求助] PCR产物无法完全测序 已有2人参与

PCR产物无法完全测序,我的序列是137bp,测序得到109bp,什么情况啊?初入分子生物学,不太懂,求指点
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遇见未知的自己
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表弟爱网游

金虫 (小有名气)

片段太短,测序最开始的几十个碱基会很不准确(引物区序列不准),所以你得到的结果会跟你期望的片段长度有一点差别。建议你连一个载体之后再测序,这样准确率会高很多。只要你的PCR样品长度大于400bp,只要浓度够,直接测序问题不大的。小于200bp,最好连载体,用通用引物测序。
当一切如飞舞的落叶坠落,惋惜之余,也要学会原谅与释怀
8楼2015-07-29 11:37:18
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查看全部 11 个回答

stone2239

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
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小小雨儿飞: 金币+2 2015-07-28 16:50:35
是连到载体上测的吗?
2楼2015-07-28 14:52:20
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neon_alone

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
小小雨儿飞: 金币+3 2015-07-28 16:51:57
你是直接测序PCR产物的吗?如果是的话,你自己的引物作为测序引物,前面是测不到,建议连接到T载体测序一下。
3楼2015-07-28 16:41:41
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小小雨儿飞

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by stone2239 at 2015-07-28 14:52:20
是连到载体上测的吗?

是PCR产物切胶回收后送测的
遇见未知的自己
4楼2015-07-28 16:50:26
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