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guyue900905

新虫 (初入文坛)

[求助] 关于引物的设计问题,请教高手指点一二,感激不尽~~ 已有1人参与

我想做屎肠球菌的pfs基因,进行pcr,但是我查找的ncbi中没有屎肠球菌的pfs基因的全序列,所以我找了粪肠球菌的pfs基因进行设计引物,但是电泳也跑不出来目的条带,现在不知道该怎么做了,请高手指点一下,真心感谢 ,实验出现问题真的很头疼,感谢感谢感谢大家!
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gnot_nail

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2015-07-27 21:50:56
为什么找粪肠的?你引物设计了几对?没有屎肠全基因的话那部分基因片段应该有吧,拿部分的基因片段去blast看最相似的是哪个物种的,然后用那个物种的全序列设计下引物试试。
2楼2015-07-27 20:13:19
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guyue900905

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by gnot_nail at 2015-07-27 20:13:19
为什么找粪肠的?你引物设计了几对?没有屎肠全基因的话那部分基因片段应该有吧,拿部分的基因片段去blast看最相似的是哪个物种的,然后用那个物种的全序列设计下引物试试。

因为我看的文献里和我做的差不多的只有粪场球菌,那部分片段应该怎么找那?
3楼2015-07-28 08:49:44
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gnot_nail

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by guyue900905 at 2015-07-28 08:49:44
因为我看的文献里和我做的差不多的只有粪场球菌,那部分片段应该怎么找那?...

。。我还以为你已经有屎肠的部分片段= =。。找的话,试试看在NCBI上搜索基因和物种的拉丁名,然后看有哪些信息。有的是序列 有的是文章,序列的话上面可能有注释可以判断 文章的话就看别人研究里有没有用的到相关的序列了。
4楼2015-07-28 19:52:08
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