24小时热门版块排行榜    

查看: 648  |  回复: 3
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

guyue900905

新虫 (初入文坛)

[求助] 关于引物的设计问题,请教高手指点一二,感激不尽~~ 已有1人参与

我想做屎肠球菌的pfs基因,进行pcr,但是我查找的ncbi中没有屎肠球菌的pfs基因的全序列,所以我找了粪肠球菌的pfs基因进行设计引物,但是电泳也跑不出来目的条带,现在不知道该怎么做了,请高手指点一下,真心感谢 ,实验出现问题真的很头疼,感谢感谢感谢大家!
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

guyue900905

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by gnot_nail at 2015-07-27 20:13:19
为什么找粪肠的?你引物设计了几对?没有屎肠全基因的话那部分基因片段应该有吧,拿部分的基因片段去blast看最相似的是哪个物种的,然后用那个物种的全序列设计下引物试试。

因为我看的文献里和我做的差不多的只有粪场球菌,那部分片段应该怎么找那?
3楼2015-07-28 08:49:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 4 个回答

gnot_nail

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2015-07-27 21:50:56
为什么找粪肠的?你引物设计了几对?没有屎肠全基因的话那部分基因片段应该有吧,拿部分的基因片段去blast看最相似的是哪个物种的,然后用那个物种的全序列设计下引物试试。
2楼2015-07-27 20:13:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gnot_nail

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by guyue900905 at 2015-07-28 08:49:44
因为我看的文献里和我做的差不多的只有粪场球菌,那部分片段应该怎么找那?...

。。我还以为你已经有屎肠的部分片段= =。。找的话,试试看在NCBI上搜索基因和物种的拉丁名,然后看有哪些信息。有的是序列 有的是文章,序列的话上面可能有注释可以判断 文章的话就看别人研究里有没有用的到相关的序列了。
4楼2015-07-28 19:52:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 国基金的申报应该改成非等额制,评价高的钱多评价低的钱少,但是增加资助率 +7 a089 2026-08-07 7/350 2026-08-08 18:05 by gltch
[基金申请] 好奇怪的filecode +3 布布和一二 2026-08-08 4/200 2026-08-08 17:46 by zhanghaozhu
[基金申请] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +3 qTvzQBRAHjCi 2026-08-07 4/200 2026-08-08 17:22 by oEVWOejN9taj
[硕博家园] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +3 qTvzQBRAHjCi 2026-08-07 4/200 2026-08-08 17:19 by oEVWOejN9taj
[基金申请] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +3 Vi50GxzrFcSG 2026-08-07 5/250 2026-08-08 16:27 by oEVWOejN9taj
[基金申请] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 Vi50GxzrFcSG 2026-08-07 4/200 2026-08-08 16:19 by oEVWOejN9taj
[公派出国] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 Vi50GxzrFcSG 2026-08-07 5/250 2026-08-08 15:59 by oEVWOejN9taj
[硕博家园] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +4 HEQlVqMTIA7d 2026-08-07 6/300 2026-08-08 14:47 by oEVWOejN9taj
[公派出国] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 HEQlVqMTIA7d 2026-08-07 6/300 2026-08-08 14:39 by oEVWOejN9taj
[基金申请] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 HEQlVqMTIA7d 2026-08-07 4/200 2026-08-08 14:27 by oEVWOejN9taj
[教师之家] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 KXLV3nuBVBY7 2026-08-07 5/250 2026-08-08 14:07 by oEVWOejN9taj
[基金申请] 关于代码变化问题,想知道的进来 +11 且听虎啸 2026-08-07 14/700 2026-08-08 12:50 by 布布和一二
[硕博家园] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 Vi50GxzrFcSG 2026-08-07 6/300 2026-08-08 10:19 by 3OOjAIS77qg2
[基金申请] 化学口download_prp&fileCode的固定段好像这几天一直没变,有变的大神么? +3 Tide man 2026-08-07 4/200 2026-08-07 22:39 by Tide man
[基金申请] 听说今天filecode变了 +24 布布和一二 2026-08-06 47/2350 2026-08-07 16:02 by zhiyanjiang
[基金申请] filecode与中标关系的预测 +3 布布和一二 2026-08-07 3/150 2026-08-07 15:09 by gltch
[基金申请] filecode变化情况 +6 布布和一二 2026-08-07 22/1100 2026-08-07 14:45 by 且听虎啸
[基金申请] filecode +8 布布和一二 2026-08-06 11/550 2026-08-06 20:41 by tangpu318
[基金申请] 影响面上的因素 +8 布布和一二 2026-08-05 11/550 2026-08-06 10:41 by 宝贝虫子
[基金申请] 纯娱乐,不喜欢勿喷 +7 Tide man 2026-08-04 10/500 2026-08-04 15:10 by loufangrui
信息提示
请填处理意见