登录注册

24小时热门版块排行榜

新虫 (初入文坛)

[求助] 关于引物的设计问题，请教高手指点一二，感激不尽~~ 已有1人参与

我想做屎肠球菌的pfs基因，进行pcr，但是我查找的ncbi中没有屎肠球菌的pfs基因的全序列，所以我找了粪肠球菌的pfs基因进行设计引物，但是电泳也跑不出来目的条带，现在不知道该怎么做了，请高手指点一下，真心感谢，实验出现问题真的很头疼，感谢感谢感谢大家！

1楼 2015-07-27 17:25:23

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

金虫 (正式写手)

★
感谢参与，应助指数 +1
西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2015-07-27 21:50:56

为什么找粪肠的？你引物设计了几对？没有屎肠全基因的话那部分基因片段应该有吧，拿部分的基因片段去blast看最相似的是哪个物种的，然后用那个物种的全序列设计下引物试试。

2楼2015-07-27 20:13:19

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

新虫 (初入文坛)

引用回帖:

2楼: Originally posted by gnot_nail at 2015-07-27 20:13:19
为什么找粪肠的？你引物设计了几对？没有屎肠全基因的话那部分基因片段应该有吧，拿部分的基因片段去blast看最相似的是哪个物种的，然后用那个物种的全序列设计下引物试试。

因为我看的文献里和我做的差不多的只有粪场球菌，那部分片段应该怎么找那？

3楼2015-07-28 08:49:44

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

金虫 (正式写手)

引用回帖:

3楼: Originally posted by guyue900905 at 2015-07-28 08:49:44
因为我看的文献里和我做的差不多的只有粪场球菌，那部分片段应该怎么找那？...

。。我还以为你已经有屎肠的部分片段= =。。找的话，试试看在NCBI上搜索基因和物种的拉丁名，然后看有哪些信息。有的是序列有的是文章，序列的话上面可能有注释可以判断文章的话就看别人研究里有没有用的到相关的序列了。

4楼2015-07-28 19:52:08

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

相关版块跳转我要订阅楼主 guyue900905 的主题更新