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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » PCR相关 » 关于引物的设计问题，请教高手指点一二，感激不尽~~
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guyue900905

新虫 (初入文坛)

[求助] 关于引物的设计问题，请教高手指点一二，感激不尽~~ 已有1人参与

我想做屎肠球菌的pfs基因，进行pcr，但是我查找的ncbi中没有屎肠球菌的pfs基因的全序列，所以我找了粪肠球菌的pfs基因进行设计引物，但是电泳也跑不出来目的条带，现在不知道该怎么做了，请高手指点一下，真心感谢 ，实验出现问题真的很头疼，感谢感谢感谢大家！
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1楼 2015-07-27 17:25:23
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gnot_nail

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2015-07-27 21:50:56
为什么找粪肠的？你引物设计了几对？没有屎肠全基因的话那部分基因片段应该有吧，拿部分的基因片段去blast看最相似的是哪个物种的，然后用那个物种的全序列设计下引物试试。
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2楼2015-07-27 20:13:19
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guyue900905

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by gnot_nail at 2015-07-27 20:13:19
为什么找粪肠的？你引物设计了几对？没有屎肠全基因的话那部分基因片段应该有吧，拿部分的基因片段去blast看最相似的是哪个物种的，然后用那个物种的全序列设计下引物试试。

因为我看的文献里和我做的差不多的只有粪场球菌，那部分片段应该怎么找那？
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3楼2015-07-28 08:49:44
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gnot_nail

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by guyue900905 at 2015-07-28 08:49:44
因为我看的文献里和我做的差不多的只有粪场球菌，那部分片段应该怎么找那？...

。。我还以为你已经有屎肠的部分片段= =。。找的话，试试看在NCBI上搜索基因和物种的拉丁名，然后看有哪些信息。有的是序列 有的是文章，序列的话上面可能有注释可以判断 文章的话就看别人研究里有没有用的到相关的序列了。
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4楼2015-07-28 19:52:08
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