| 查看: 1784 | 回复: 16 | |||
[交流]
系统发育树相关
|
| 最近在看新种鉴定的相关文献，有个问题想请教相关的虫友。我做的是真菌的鉴定，我查阅了最近几年（2010-2015）的新种鉴定的文献，这几年的文献中在构建系统发育树的时候，已经不是单纯运用ITS序列进行建树，而是会将多个基因位点的序列整合到一起，然后用专业的发育树软件（PAUP）进行建树。例如，将ITS,beta-tubulin，calmodulin这三个位点的基因整合到一起，用PAUP软件建树之后，从中选出最合适的树。在这个过程当中，如何将这三个位点的基因整合到一起进行分析？还有用MrBayes软件进行验证，这个软件具体又是怎么用呢？希望得到懂这方面的虫友的耐心回复，谢谢！ |
回复此楼» 猜你喜欢
Wnt-C59：PORCN靶向化学探针，Wnt信号通路阻断机制与科研应用全解析
已经有0人回复
-
Fexaramine：肠道限制性FXR化学探针，结构特征与信号通路研究全解析
已经有0人回复
-
化学工程及工业化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有170人回复
-
NVS-STG2：靶向STING跨膜域的分子胶类激动剂，结构特征与寡聚化机制研究全解析
已经有0人回复
-
DOTA-GPC3肽（CAS 3066439-94-6）：双功能分子探针前体的结构特征与标记应用解析
已经有0人回复
-
科研用 TLR7/8 双激动剂怎么选？现货与质控要点
已经有0人回复
-
SEL120-34A HCl：CDK8/CDK19高选择性激酶抑制剂
已经有0人回复
-
氢氧化钾活化操作
已经有18人回复
-
散金
已经有68人回复
-
生物质超级电容器
已经有0人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 做系统发育树确定细菌的菌属的相关问题
已经有0人回复
- 系统发育相关问题
已经有3人回复
- 求助Philip系统发育树相关问题
已经有1人回复
- 系统发育树相关问题
已经有1人回复
- 有人会处理炭疽属的分子系统发育建树数据吗？？？急求建树方法！！！
已经有3人回复
- 细菌16S rDNA测序结果有了，如何建立系统发育树啊，之前的贴子没看懂。
已经有9人回复
- 求助关于PAUP和MEGA构建系统树的问题
已经有2人回复
- 细菌的系统发育树—新手求助
已经有0人回复
- 关于18s rDNA 建系统树的问题
已经有6人回复
- 系统发育树构建
已经有31人回复
- paup软件命令的详细说明及相关文献
已经有6人回复
- 散金币求如何建立系统发育树啊
已经有3人回复
- 【教程】PAUP 4.0 快速开始指南
已经有54人回复
- 【求助/交流】鉴定出细菌的16SrDNA，请问如何构建系统发育树？
已经有6人回复
- 生物学软件介绍及其下载地址【学生物的会很有用】
已经有24人回复
 |
2楼2015-07-15 23:03:35
Fleaves
至尊木虫 (著名写手)
- 应助: 100 (初中生)
- 金币: 18980.6
- 散金: 526
- 红花: 42
- 帖子: 2644
- 在线: 412.1小时
- 虫号: 1473397
- 注册: 2011-11-02
- 性别: GG
- 专业: 植物病理学
3楼2015-07-16 00:18:14
阿Q~~
至尊木虫 (文坛精英)
- 应助: 77 (初中生)
- 金币: 33343.6
- 红花: 107
- 帖子: 36186
- 在线: 1028.1小时
- 虫号: 3237212
- 注册: 2014-05-27
- 性别: MM
- 专业: 宇宙学
4楼2015-07-16 05:58:27
mzhyan
至尊木虫 (文坛精英)
- 应助: 712 (博后)
- 金币: 37461.7
- 红花: 24
- 帖子: 45756
- 在线: 287.3小时
- 虫号: 1191620
- 注册: 2011-01-18
- 专业: 环境污染化学
5楼2015-07-16 08:24:29
6楼2015-07-16 08:30:58
xumin-0120
铁虫 (小有名气)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 680.3
- 散金: 2
- 帖子: 109
- 在线: 67.7小时
- 虫号: 643480
- 注册: 2008-11-02
- 专业: 动物资源与保护
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
西门吹雪170: 金币+3, 鼓励回帖交流 2015-07-17 22:54:27
季波: 金币+3, 谢谢回复，评分晚了，不要介意 2015-07-19 17:09:46
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
西门吹雪170: 金币+3, 鼓励回帖交流 2015-07-17 22:54:27
季波: 金币+3, 谢谢回复，评分晚了，不要介意 2015-07-19 17:09:46
|
三条序列是否能够整合，先要判断一致性，一致性高，可以整合，就是三条序列串联在一起分析； 采用MP法，PAUP最好；MrBaye 则是采用贝叶斯法，不同的方法需要不同的软件分析，建议你先仔细分析你看到文献内容，研究他的分析方法，先重复他 的分析方法，然后再分析自己的数据~ 多读一些这方面的书籍比较好。 推荐一本我在看的书《分子系统发生学》，黄原著~ |
7楼2015-07-17 12:15:50
Crescendo
铁杆木虫 (著名写手)
- 应助: 32 (小学生)
- 金币: 5821.1
- 散金: 152
- 红花: 15
- 帖子: 1311
- 在线: 375.2小时
- 虫号: 989569
- 注册: 2010-04-05
- 性别: GG
- 专业: 植物病理学
8楼2015-07-17 21:55:25
9楼2015-07-19 17:16:59
10楼2015-07-19 17:21:00
投票:
10