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[交流]
系统发育树相关
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| 最近在看新种鉴定的相关文献，有个问题想请教相关的虫友。我做的是真菌的鉴定，我查阅了最近几年（2010-2015）的新种鉴定的文献，这几年的文献中在构建系统发育树的时候，已经不是单纯运用ITS序列进行建树，而是会将多个基因位点的序列整合到一起，然后用专业的发育树软件（PAUP）进行建树。例如，将ITS,beta-tubulin，calmodulin这三个位点的基因整合到一起，用PAUP软件建树之后，从中选出最合适的树。在这个过程当中，如何将这三个位点的基因整合到一起进行分析？还有用MrBayes软件进行验证，这个软件具体又是怎么用呢？希望得到懂这方面的虫友的耐心回复，谢谢！ |
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10楼2015-07-19 17:21:00
阿Q~~
至尊木虫 (文坛精英)
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4楼2015-07-16 05:58:27
xumin-0120
铁虫 (小有名气)
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西门吹雪170: 金币+3, 鼓励回帖交流 2015-07-17 22:54:27
季波: 金币+3, 谢谢回复，评分晚了，不要介意 2015-07-19 17:09:46
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季波: 金币+3, 谢谢回复，评分晚了，不要介意 2015-07-19 17:09:46
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三条序列是否能够整合，先要判断一致性，一致性高，可以整合，就是三条序列串联在一起分析； 采用MP法，PAUP最好；MrBaye 则是采用贝叶斯法，不同的方法需要不同的软件分析，建议你先仔细分析你看到文献内容，研究他的分析方法，先重复他 的分析方法，然后再分析自己的数据~ 多读一些这方面的书籍比较好。 推荐一本我在看的书《分子系统发生学》，黄原著~ |
7楼2015-07-17 12:15:50
Crescendo
铁杆木虫 (著名写手)
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8楼2015-07-17 21:55:25
