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rola234新虫 (小有名气)
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PCR扩增没有结果,求教是引物Tm值相差太大,还是模板GC含量太高? 已有8人参与
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| 这两天通过PCR扩增一个基因,基因本身比较长,大约1800bp左右,这个基因序列的GC含量为66%,总体上看还算正常,但当中有三四个区段的GC含量特别特别高,就是出现连续几十个甚至上百个GC碱基这样的序列,我设计的上游引物Tm之大约50.6℃,下游引物引物带入了一个NotI酶切位点,因此Tm值达到了66.8℃,两个引物的Tm值相差得有点大,今天试着做了一次PCR,但没有结果,我将退火温度从50℃到65℃做了一个梯度,但P了10管,都没有结果,非特异性扩增也几乎没有,只有最下面有一些引物二聚体。我确信我没有加错或者漏加东西,而且琼脂糖电泳也没有问题,就不太清楚到底是什么导致了PCR扩增没有结果,考虑来考虑去,觉得只有引物和模板的问题比较大,但不确定问题到底出在哪,求教小木虫上的各位高手了! |
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sandycool
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