24小时热门版块排行榜    

查看: 3093  |  回复: 16

xcchh

银虫 (小有名气)

[求助] 有做过SNP检测的吗?请进啊 已有5人参与

有做过SNP检测的吗?采用的是Taqman MGB 还是 高分辨率熔解曲线的方法?哪种比较主流,检测更为准确?
还望知无不言言无不尽啊,欢迎交流
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wsad5213

银虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
我做SNP的,但是我直接送去生工测序,然后再分析突变位点,最后分析单倍型什么的
2楼2015-06-30 16:11:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xcchh

银虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by wsad5213 at 2015-06-30 16:11:37
我做SNP的,但是我直接送去生工测序,然后再分析突变位点,最后分析单倍型什么的

哦,好吧,那不是通过荧光PCR分析吗?
3楼2015-06-30 16:25:10
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Libra-z

银虫 (小有名气)

没做过,了解过一些……高分辨熔解曲线很准确,但仪器是专门的仪器,很贵,一半实验室没有吧……

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
4楼2015-06-30 17:15:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wsad5213

银虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by xcchh at 2015-06-30 16:25:10
哦,好吧,那不是通过荧光PCR分析吗?...

那边测序后会有峰值图,根据峰值图可以分析出某一位点是发生什么突变(突变处会出现双峰),并且知道这个突变是哪种突变!我是这样分析的!溶解曲线的分析方法跟我这种类似,只不过曲线不一样吧,你的量大么?如果不是很多的话还是直接测序把,省钱省时
5楼2015-06-30 20:53:03
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

王平阳

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
xcchh: 金币+10 2015-07-02 13:22:14
我们这边做过SNP位点筛选,现实使用的HRM,高技术对各方面要求都比较高,我们用的仪器是罗氏的lightcycle96,用的荧光染料是LC Green,做了很多次,发现重复性不太好,而且对模板要求很高,聚合酶也必须是高保真,如果你做的是高通量,可以尝试用HRM,如果量少建议采用测序的方法。谢谢!
没有做不到,只有想不到!
6楼2015-06-30 21:42:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

starseeker

铜虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
我做过Taqman-MGB探针,因为Taqman探针的长度一般在20bp内,如果你只是检测少数集中的SNP位点,Taqman探针是个不错的方法……合成2OD的探针大约2000~2500元。
但是如果样品少且SNP位点分布很分散,建议直接测序分析。
7楼2015-07-01 08:29:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

易水秋寒

银虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
正在做SNP检测,以前用过HRM,效果还不错,目前正在研讨新方法。。。
8楼2015-07-01 14:15:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

小小逍遥人

金虫 (正式写手)

张斌猪

这个最准确的是测序法,但是这个价格比较贵,适合少量样品和少位点,多位点的大量样品就用HRM把  ps我们是技术服务公司
生命还需要奇迹来衬托
9楼2015-07-01 14:16:45
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xcchh

银虫 (小有名气)

引用回帖:
6楼: Originally posted by 王平阳 at 2015-06-30 21:42:11
我们这边做过SNP位点筛选,现实使用的HRM,高技术对各方面要求都比较高,我们用的仪器是罗氏的lightcycle96,用的荧光染料是LC Green,做了很多次,发现重复性不太好,而且对模板要求很高,聚合酶也必须是高保真,如 ...

我这边只是做同一个基因单个位点的野生型和突变型检测,不知道HRM效果会怎样?请问一下有同时做过Taqman MGB的方法吗?我现在不确定的是这两种方法哪一个检测的准确性,操作性更高,谢谢
10楼2015-07-01 16:45:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 xcchh 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 关于filecode +4 布布和一二 2026-08-07 7/350 2026-08-07 22:55 by zhanghaozhu
[基金申请] 娱乐 +6 Tide man 2026-08-03 6/300 2026-08-07 22:40 by 铁帽子农民
[基金申请] 化学口download_prp&fileCode的固定段好像这几天一直没变,有变的大神么? +3 Tide man 2026-08-07 4/200 2026-08-07 22:39 by Tide man
[基金申请] 关于代码变化问题,想知道的进来 +9 且听虎啸 2026-08-07 12/600 2026-08-07 21:53 by 理想三旬2025
[基金申请] 固定端突然变了,今天 +6 archvillain 2026-08-06 10/500 2026-08-07 16:03 by 医学老男孩
[基金申请] 听说今天filecode变了 +24 布布和一二 2026-08-06 47/2350 2026-08-07 16:02 by zhiyanjiang
[基金申请] filecode与中标关系的预测 +3 布布和一二 2026-08-07 3/150 2026-08-07 15:09 by gltch
[基金申请] filecode变化情况 +6 布布和一二 2026-08-07 22/1100 2026-08-07 14:45 by 且听虎啸
[论文投稿] 十年后又回来了,论文投稿求助 +4 哈哈114477 2026-08-01 4/200 2026-08-07 14:39 by jgy194592
[基金申请] 大家散了吧,后缀研究没有意义,别浪费时间了,过好目前的每一天,不要焦虑 +5 Tide man 2026-08-06 7/350 2026-08-07 13:11 by 医学老男孩
[基金申请] 关于豆爷回答的JTJC与%2F数量 +4 yang182083 2026-08-06 6/300 2026-08-07 12:43 by 虫友是什么虫
[基金申请] filecode +14 等待解的谜 2026-08-06 19/950 2026-08-07 12:20 by wlwhappy
[基金申请] 求各位大神看下 100+6 hpkpkpkp 2026-08-05 33/1650 2026-08-06 14:49 by zhiyanjiang
[基金申请] 影响面上的因素 +8 布布和一二 2026-08-05 11/550 2026-08-06 10:41 by 宝贝虫子
[基金申请] 8月时间戳变的,举个手。玩一下,释放压力 +9 archvillain 2026-08-04 11/550 2026-08-05 20:06 by wlwhappy
[基金申请] 好消息?这个有何含义??? +8 Tide man 2026-08-05 10/500 2026-08-05 16:14 by xmuxiaoyu
[考博] 【2027博士申请】纳米药物递送方向 20+3 13586093586 2026-08-03 4/200 2026-08-05 09:59 by lfy8008
[基金申请] 有没有H口的?有收到消息的吗? +3 超级海虾 2026-08-04 3/150 2026-08-04 17:26 by 学教育滴
[基金申请] 面上提前没消息,有中的吗 +14 archvillain 2026-08-02 18/900 2026-08-04 14:42 by archvillain
[基金申请] 什么时候能放榜呀? +3 Jacob678 2026-08-03 3/150 2026-08-03 16:14 by gltch
信息提示
请填处理意见