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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » 量化新手直通车 » 用Origin怎么做这样的HOMO-LUMO能级图？求详细
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菜鸟都不算

新虫 (小有名气)

[求助] 用Origin怎么做这样的HOMO-LUMO能级图？求详细 已有2人参与

我是用Gaussian算出来的结果想要做出这样的图。请详细教授，谢谢了！！！

用Origin怎么做这样的HOMO-LUMO能级图？求详细
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1楼 2015-06-23 15:44:04
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小范范1989

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
1：从你的log文件中，找到如下的表述：
Alpha  occ. eigenvalues --   -0.41160  -0.41003  -0.40475  -0.40430  -0.40417
Alpha  occ. eigenvalues --   -0.40379  -0.40290  -0.39842  -0.39804  -0.39458
Alpha  occ. eigenvalues --   -0.39440  -0.39419  -0.39259  -0.38971  -0.38854
Alpha  occ. eigenvalues --   -0.37816  -0.37801  -0.37355  -0.37332  -0.36794
Alpha  occ. eigenvalues --   -0.36549  -0.35652  -0.34648  -0.32921  -0.32739
Alpha  occ. eigenvalues --   -0.32367  -0.32279  -0.31354  -0.31335  -0.29704
Alpha  occ. eigenvalues --   -0.29622  -0.29324  -0.28800  -0.28353  -0.28338
Alpha  occ. eigenvalues --   -0.25827  -0.25767  -0.25536  -0.25429  -0.24041
Alpha  occ. eigenvalues --   -0.24023  -0.22502  -0.22458
Alpha virt. eigenvalues --   -0.05754  -0.03972  -0.02434  -0.02300  -0.01075
Alpha virt. eigenvalues --   -0.01057   0.00541   0.00872   0.01059   0.01677
Alpha virt. eigenvalues --    0.02628   0.02645   0.04299   0.04403   0.05251
Alpha virt. eigenvalues --    0.05487   0.05969   0.06093   0.06690   0.06719
Alpha virt. eigenvalues --    0.11598   0.11953   0.12239   0.12785   0.12904
Alpha virt. eigenvalues --    0.13369   0.13512   0.13561   0.13639   0.14255
Alpha virt. eigenvalues --    0.14826   0.15297   0.16253   0.16310   0.17036
当然，数据可以更多或者更少。
2：在origin】中，x坐标全部设置为1  Y坐标就把上面的数据输入，置于输入多少或者单位换算，这些你应该都知道。然后点击作图，作出来的应该是全是一些小点点。
3：origin中双击，设置symbol中的size，以及昨天这个倒三角形的样式，改为横线就ok了
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It doesn't matter how slow you are, as long as you're determined to get there, you'll get there.
2楼2015-06-23 16:34:52
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小范范1989

木虫 (著名写手)
sorry，第三条中的昨天，打错了，是左边。
ps：上面是我做能级图的时候的方式，不一定准确，希望高手们多多指点。
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It doesn't matter how slow you are, as long as you're determined to get there, you'll get there.
3楼2015-06-23 16:36:08
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lastzealot

新虫 (著名写手)

【乱世的奸雄】
引用回帖:
3楼: Originally posted by 小范范1989 at 2015-06-23 16:36:08
sorry，第三条中的昨天，打错了，是左边。
ps：上面是我做能级图的时候的方式，不一定准确，希望高手们多多指点。

你好，你帮我回答过好多问题了，首先谢谢你。
在这里又遇到你了，顺便问你个问题吧。
我也在做NBO分析，但是刚刚开始学习NBO。
1. NBO分析的关键词是不是pop=nbo还是nboread还是其他的什么？
2. 分析数据时哪些时候需要把.chk文件变成.fchk文件呢？请问如何变幻？哪些时候直接分析.chk就可以了？
3. 计算完nbo的.out文件里是否有关于HOMO-LUMO前线轨道的数据呢？请问如何把数据提取出来呢？

谢谢，别笑话我哦~~~~~~~~~
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4楼2015-06-23 22:04:56
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chw5842036

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
引用回帖:
4楼: Originally posted by lastzealot at 2015-06-23 22:04:56
你好，你帮我回答过好多问题了，首先谢谢你。
在这里又遇到你了，顺便问你个问题吧。
我也在做NBO分析，但是刚刚开始学习NBO。
1. NBO分析的关键词是不是pop=nbo还是nboread还是其他的什么？
2. 分析数据时哪些 ...

你说的nbo可以在高斯view中选择，里面有nbo这个选择，至于fchk，一般都是在Linux系统吧chk文件转换成fchk，因为在win下只能打开Linux系统运行的fchk文件，格式是formchk 文件加上chk 文件加上fchk, 看轨道的话需要fchk文件才能查看，out文件是不能查看的

[ 发自小木虫客户端 ]
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相信自己，不放弃
5楼2015-06-23 22:30:36
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lastzealot

新虫 (著名写手)

【乱世的奸雄】
引用回帖:
5楼: Originally posted by chw5842036 at 2015-06-23 22:30:36
你说的nbo可以在高斯view中选择，里面有nbo这个选择，至于fchk，一般都是在Linux系统吧chk文件转换成fchk，因为在win下只能打开Linux系统运行的fchk文件，格式是formchk 文件加上chk 文件加上fchk, 看轨道的话需要 ...

谢谢你得帮助，但是我还是没看懂
1. gview里面哪里有nbo选项？我怎么没找到？
2. 在linux系统下请问如何把chk转换成fchk，用哪个命令呢？
    formchk file.chk file.fchk
    请问是这种格式吗？
3. 转换成fchk后是不是用gview打开就可以了？


谢谢
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6楼2015-06-23 22:53:10
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小范范1989

木虫 (著名写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by lastzealot at 2015-06-23 22:04:56
你好，你帮我回答过好多问题了，首先谢谢你。
在这里又遇到你了，顺便问你个问题吧。
我也在做NBO分析，但是刚刚开始学习NBO。
1. NBO分析的关键词是不是pop=nbo还是nboread还是其他的什么？
2. 分析数据时哪些 ...

你客气了，我们 交流问题，怎么会有笑话之说的。谁都是从不懂开始，慢慢接触，最后到熟悉，最后的术业专攻。
1：这个NBO的计算是一个很重要的计算，我当时也是偶尔看看，因为我还没有真正的用到，你看看sob老师的这个帖子
http://ccc.keinsci.com/forum.php?mod=viewthread&tid=102
以及小木虫beefly大神的帖子，等等
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=1585328
2：转化为fchk，需要用到高斯自带的formchk程序，你要是再linux下转换，需要用到/路径/formchk  file.chk  file.fchk
要是再window下转化，有个utilities 里面的formchk就可以转换了
3：可以吧计算的log文件（或者是out文件），放到高斯view中，然后点击一个类似于8的按钮，上面是绿色，下面是红色，在高斯view的第四行，会出现一个图像，里面有分子轨道，你一看就明白了
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It doesn't matter how slow you are, as long as you're determined to get there, you'll get there.
7楼2015-06-24 07:47:03
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lastzealot

新虫 (著名写手)

【乱世的奸雄】
引用回帖:
7楼: Originally posted by 小范范1989 at 2015-06-24 07:47:03
你客气了，我们 交流问题，怎么会有笑话之说的。谁都是从不懂开始，慢慢接触，最后到熟悉，最后的术业专攻。
1：这个NBO的计算是一个很重要的计算，我当时也是偶尔看看，因为我还没有真正的用到，你看看sob老师的 ...

非常感谢，我找到那个8了。
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8楼2015-06-24 10:02:13
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gx730

金虫 (正式写手)
楼主好，想请问一下这样的能级图能得到什么样的信息呢?
和lomo homo轨道图要结合分析吗？
非常感谢
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9楼2015-06-24 11:21:27
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