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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » DMOL3 溶质与溶剂间作用力
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Jounry-Jo

银虫 (小有名气)

[求助] DMOL3 溶质与溶剂间作用力 已有1人参与

请教一下用过Dmol3模块的前辈，两分子（一个溶质分子，一个溶剂分子）分别经过几何优化后，如何结合在一起得到下图并计算键能？或者说，开始就应该用两个分子一起优化？

DMOL3 溶质与溶剂间作用力
{2{%P_7_HI}K(BH%7U1HV98.png


DMOL3 溶质与溶剂间作用力-1
{2{%P_7_HI}K(BH%7U1HV98.png
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1楼 2015-06-23 13:06:38
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catherine56

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

我做的跟你差不多，应该是先单独几何优化，然后再放到一起，加氢键，计算
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2楼2015-07-10 15:26:06
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Jounry-Jo

银虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by catherine56 at 2015-07-10 15:26:06
我做的跟你差不多，应该是先单独几何优化，然后再放到一起，加氢键，计算

请问你用的什么板块，compass force? 感觉氢键的键距和键角影响挺大的
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3楼2015-07-10 21:59:27
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