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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 分子生理 » 求教 模拟酶蛋白结合底物位点
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mimi_pudding

金虫 (小有名气)

[交流] 求教 模拟酶蛋白结合底物位点

各位大侠~
我们想研究 一种酶A能够对底物B进行还原催化，有没有相关的分子模拟软件？能对酶的底物结合位点等进行预测，然后给出结合该种底物的可能性？
这只是我的预想~不知能否可行 或者有类似的文献呢？In silico之类的？
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1楼 2015-05-28 09:01:52
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mimi_pudding

金虫 (小有名气)
我自己顶呀自己顶~求大家帮助~
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2楼2015-05-28 11:16:10
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lxj341401

至尊木虫 (著名写手)
★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
mimi_pudding: 金币+5, 谢谢谢谢~这么仔细 只是我不太懂这方面，抄下来慢慢消化消化~有不懂的 想再麻烦向您请教呀~ 2015-05-29 10:44:15
从分子机理上研究一种酶A能够对底物B进行的还原催化，如果酶A已经有晶体结构，可以直接使用Autodock或者Dock等软件分子对接软件与底物进行分子对接，对酶和底物结合进行预测；如果酶A还没有空间结构，用采用同源建模的方式（如SWISSMODEN）对酶进行结构模拟，然后将模拟的结构作为受体与配体也就是底物进行分子对接研究，分析酶与底物结合的可能方式和结合位点。
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3楼2015-05-28 17:00:04
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longdlut

捐助贵宾 (著名写手)
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★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
通过分子对接进行预测分析，结合构象，作用位置，相互作用的氨基酸区域！
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4楼2015-06-02 15:56:29
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