| 查看: 4061 | 回复: 4 | ||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | ||
[求助]
如何显示对接后蛋白结合口袋的截面图 已有2人参与
|
||
|
本人从事分子模拟不久，已经通过Autodock Vina对一些分子进行对接。分析对接结果的时候不知道如何显示蛋白口袋的截面图，以更直观地看到小分子在什么程度上适应蛋白口袋。附图是Autodock Vina官网上显示的对接结果图，请问如何可以做这样的图？ 我已经试过用Pymol的present-Ligand site和ADT里面的Protein surface，可是都不能得到附件中所示的样子。麻烦高手支招有什么软件可以做到吗？麻烦给详细的作图步骤~~~小女子感激不尽~~~~ 另外，请问有什么软件可以用于虚拟筛选得到的小分子superimpose还有结构分析？分析官能团，氢键受体供体，极性，亲脂性和骨架？谢谢大家！  Untitled.jpg |
回复此楼» 猜你喜欢
求调剂推荐
已经有7人回复
-
289 分105500药学专硕求调剂(找B区学校)
已经有4人回复
-
0854求调剂
已经有13人回复
-
初试324 中药学 一志愿天中医 求调剂
已经有3人回复
-
药学求调剂
已经有14人回复
-
327求调剂
已经有27人回复
-
急需调剂
已经有5人回复
-
300求调剂
已经有7人回复
-
271求调剂
已经有33人回复
-
273求调剂
已经有8人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- Autodock蛋白处理时，保留在蛋白的原配体如何处理？
已经有12人回复
- 在autodock软件中如何将配体和受体拆分开
已经有9人回复
- 对接的分子用于分子动力学模拟的问题
已经有12人回复
- 分子对接时配体跟受体分开很远，配体不在受体活性口袋
已经有7人回复
- Autodock时 gridbox的参数怎么设置??
已经有18人回复
- 【在线答疑】UCSF DOCK分子对接和虚拟筛选
已经有42人回复
5楼2016-07-11 16:15:38
2楼2015-05-14 09:38:23
3楼2015-05-15 06:51:47
