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如何显示对接后蛋白结合口袋的截面图 已有2人参与
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本人从事分子模拟不久，已经通过Autodock Vina对一些分子进行对接。分析对接结果的时候不知道如何显示蛋白口袋的截面图，以更直观地看到小分子在什么程度上适应蛋白口袋。附图是Autodock Vina官网上显示的对接结果图，请问如何可以做这样的图？ 我已经试过用Pymol的present-Ligand site和ADT里面的Protein surface，可是都不能得到附件中所示的样子。麻烦高手支招有什么软件可以做到吗？麻烦给详细的作图步骤~~~小女子感激不尽~~~~ 另外，请问有什么软件可以用于虚拟筛选得到的小分子superimpose还有结构分析？分析官能团，氢键受体供体，极性，亲脂性和骨架？谢谢大家！  Untitled.jpg |
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