| 查看: 4257 | 回复: 4 | ||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | ||
[求助]
如何显示对接后蛋白结合口袋的截面图 已有2人参与
|
||
|
本人从事分子模拟不久，已经通过Autodock Vina对一些分子进行对接。分析对接结果的时候不知道如何显示蛋白口袋的截面图，以更直观地看到小分子在什么程度上适应蛋白口袋。附图是Autodock Vina官网上显示的对接结果图，请问如何可以做这样的图？ 我已经试过用Pymol的present-Ligand site和ADT里面的Protein surface，可是都不能得到附件中所示的样子。麻烦高手支招有什么软件可以做到吗？麻烦给详细的作图步骤~~~小女子感激不尽~~~~ 另外，请问有什么软件可以用于虚拟筛选得到的小分子superimpose还有结构分析？分析官能团，氢键受体供体，极性，亲脂性和骨架？谢谢大家！  Untitled.jpg |
回复此楼» 猜你喜欢
国自然面上复盘~欢迎讨论
已经有6人回复
-
售SCI一区文章，我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急
已经有4人回复
-
有多少人是今天查系统知道结果的？
已经有17人回复
-
售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急
已经有4人回复
-
基金不中，共勉
已经有5人回复
-
看板上这么多中的，有点像50人群里49个人都是骗子的那种感觉……
已经有3人回复
-
我不理解！
已经有23人回复
-
2026年的国家社科基金项目通讯评审的新规则与新动向、新挑战
已经有10人回复
-
系统查不到
已经有10人回复
-
怎么查啊
已经有5人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- Autodock蛋白处理时，保留在蛋白的原配体如何处理？
已经有12人回复
- 在autodock软件中如何将配体和受体拆分开
已经有9人回复
- 对接的分子用于分子动力学模拟的问题
已经有12人回复
- 分子对接时配体跟受体分开很远，配体不在受体活性口袋
已经有7人回复
- Autodock时 gridbox的参数怎么设置??
已经有18人回复
- 【在线答疑】UCSF DOCK分子对接和虚拟筛选
已经有42人回复
3楼2015-05-15 06:51:47
2楼2015-05-14 09:38:23
5楼2016-07-11 16:15:38
