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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » gromacs做膜蛋白如何调整膜的位置
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Paris7081

新虫 (初入文坛)

[求助] gromacs做膜蛋白如何调整膜的位置 已有1人参与

哪位大神指导一下，我做蛋白嵌入膜里时，z轴方向蛋白出来了，我想把膜向上移一下，改如何操作
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1楼 2015-04-15 20:45:15
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jerkwin

专家顾问 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
Paris7081(abinitio代发): 金币+2, 鼓励交流 2015-04-17 07:37:17
把坐标沿z轴平移一下就可以了
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2楼2015-04-15 21:00:50
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Paris7081

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by jerkwin at 2015-04-15 21:00:50
把坐标沿z轴平移一下就可以了

能告诉我具体如何平移吗，同时我不想让蛋白位置变化，只想移动脂质
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3楼2015-04-16 07:49:59
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jerkwin

专家顾问 (正式写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by Paris7081 at 2015-04-16 07:49:59
能告诉我具体如何平移吗，同时我不想让蛋白位置变化，只想移动脂质...

把gro文件中的坐标改变下就是了
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4楼2015-04-16 08:22:40
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Paris7081

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
4楼: Originally posted by jerkwin at 2015-04-16 08:22:40
把gro文件中的坐标改变下就是了...

我想讲z轴的坐标加1，不过有6千多个，不可能手动改，请问大神您知道那个命令，或是脚本可以整体上加1吗，跪求，
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5楼2015-04-16 10:38:12
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jerkwin

专家顾问 (正式写手)
引用回帖:
5楼: Originally posted by Paris7081 at 2015-04-16 10:38:12
我想讲z轴的坐标加1，不过有6千多个，不可能手动改，请问大神您知道那个命令，或是脚本可以整体上加1吗，跪求，...

editconf或自己做
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6楼2015-04-16 12:46:18
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