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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » 根据径向分布函数求配位数
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176286641cc

新虫 (小有名气)

[求助] 根据径向分布函数求配位数 已有2人参与

用MS做出了径向分布函数曲线，曲线的峰值、峰谷都跟模拟的文章十分接近，把径向分布函数的数据拷贝到origin里面，记下第一峰谷位，再对其积分，出来一条配位数曲线，找出配位数曲线中对应第一峰谷位的值，作为第一壳层配位数。现在的问题是：我算的配位数是1.9，而模拟的文章给出的配位数是6.3，差距太大了，请大家帮忙看看问题到底出在哪儿了呢？谢谢！
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径向分布函数 分子模拟

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小虫期待破茧成蝶！
1楼 2015-04-12 15:12:40
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回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

郭倪倪倪倪

铁虫 (小有名气)
请问可以把这个6.3的文献连接发一下吗
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8楼2019-11-11 19:08:50
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普通回帖

176286641cc

新虫 (小有名气)
感谢！
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小虫期待破茧成蝶！
2楼2015-04-12 16:29:42
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abinitio

版主 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
没看明白，其它只要将g(r)的积分*4pi*^2就可以了。试试
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3楼2015-04-13 10:52:08
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biancheng159

铜虫 (正式写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by abinitio at 2015-04-13 10:52:08
没看明白，其它只要将g(r)的积分*4pi*^2就可以了。试试

不是g(r)*4*pi*r^2*ρ吗？
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so,hu r u?
4楼2015-04-13 13:06:00
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abinitio

版主 (著名写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by biancheng159 at 2015-04-13 13:06:00
不是g(r)*4*pi*r^2*ρ吗？...

对。
5楼2015-04-13 13:52:28
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176286641cc

新虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by biancheng159 at 2015-04-13 13:06:00
不是g(r)*4*pi*r^2*ρ吗？...

我的体系中离子和水分子的个数为256个，其中水分子254个，阴阳离子各一个，溶液密度为1.023g/cm^3，请问这个体系下的ρ怎么算呢？谢谢！
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小虫期待破茧成蝶！
6楼2015-04-13 16:47:52
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biancheng159

铜虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
176286641cc: 金币+5, ★★★很有帮助 2015-04-14 14:52:48
引用回帖:
6楼: Originally posted by 176286641cc at 2015-04-13 16:47:52
我的体系中离子和水分子的个数为256个，其中水分子254个，阴阳离子各一个，溶液密度为1.023g/cm^3，请问这个体系下的ρ怎么算呢？谢谢！...

数目密度=指定类型的原子总数/体积   
体积通常用盒子体积就可以了吧。
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so,hu r u?
7楼2015-04-14 11:36:23
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啦啦啦8023

新虫 (小有名气)
引用回帖:
6楼: Originally posted by 176286641cc at 2015-04-13 16:47:52
我的体系中离子和水分子的个数为256个，其中水分子254个，阴阳离子各一个，溶液密度为1.023g/cm^3，请问这个体系下的ρ怎么算呢？谢谢！...

麻烦问一下你算水和离子的时候是用什么模块来算的吖？是用的什么力场吖？之前我用pcff算的时候每次优化完结构，锂的电荷就变成了0?

发自小木虫Android客户端
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9楼2019-12-05 22:32:37
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pl967

禁虫 (小有名气)
本帖内容被屏蔽
10楼2019-12-31 16:15:12
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