应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » 【已求助成功】如何从radial distribution function得到各层配位数
北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
101/1返回列表
查看: 4245  |  回复: 9
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

wjqhp

木虫 (正式写手)

[交流] 【已求助成功】如何从radial distribution function得到各层配位数 已有6人参与

求助：想从RDF得到各层配位数。
困难：RDF图从Forcite里面的radial distribution function已经 得到。cluster模型为309个原子的icosahedron. 请教大家如何得到原子周围的配位数？我不会分析这个RDF. 为什么只是得到一张图和表格数据，而没有所谓的函数呢？似乎通过函数积分可以计算，但从图和数据表出发也得不到函数。

期待大家帮助了，谢谢；

模型数据图片和RDF数据：
http://cid-da311af543e0273b.office.live.com/browse.aspx/.Public

[ Last edited by zzy870720z on 2010-7-1 at 08:15 ]
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

我学习计算的一些帖子 径向分布函数

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
QQ：584473782欢迎访问http://leorunfast.wordpress.com
1楼 2010-06-29 12:09:23
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wuchenwf

荣誉版主 (职业作家)
★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
gavinliu7390(金币+2):谢谢交流！ 2010-06-29 15:15:33
xiaohunhun(金币+1):谢谢 2010-06-29 15:30:10
wjqhp(金币+2):希望能继续给点指导，很多人说积分，问题是俺不知道怎么积分法。 2010-06-30 08:43:25
如果是多元体系，要得到组元a附近的B的话，就要算偏rdf。如果只是要得到某个原子周围的总配位数，将RDF对距离积分即可。
赞一下(3人) 回复此楼
2楼2010-06-29 14:37:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wjqhp

木虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by wuchenwf at 2010-06-29 14:37:26:
如果是多元体系，要得到组元a附近的B的话，就要算偏rdf。如果只是要得到某个原子周围的总配位数，将RDF对距离积分即可。

似乎看到了解决问题的希望，谢谢你的回复。

您能下载我附的文件吗？我做的是单组分，Au 的cluster，形状为icosahedron.得到的RDF以导出为txt文件。我的问题就是不会利用这些数据进行积分。我想通过这个RDF得到Au 原子第一、第二近邻层的原子数目。
希望大侠指点，谢谢
赞一下 回复此楼
QQ：584473782欢迎访问http://leorunfast.wordpress.com
3楼2010-06-30 04:06:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wuchenwf

荣誉版主 (职业作家)
★
lvjian8596(金币+1):感谢交流！ 2010-06-30 19:35:22
引用回帖:
Originally posted by wjqhp at 2010-06-30 04:06:43:

似乎看到了解决问题的希望，谢谢你的回复。

您能下载我附的文件吗？我做的是单组分，Au 的cluster，形状为icosahedron.得到的RDF以导出为txt文件。我的问题就是不会利用这些数据进行积分。我想通过这个RDF得 ...

积分是思想、理论。但是实际上的处理方法是，给定一个截断半径，然后数这个半径内原子的个数，就叫在这个半径范围内的积分了
赞一下(1人) 回复此楼
4楼2010-06-30 18:00:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wjqhp

木虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by wuchenwf at 2010-06-30 18:00:42:

积分是思想、理论。但是实际上的处理方法是，给定一个截断半径，然后数这个半径内原子的个数，就叫在这个半径范围内的积分了

您是说在RDF图上数截断半径内的原子个数吗？我也不会数啊。能否具体指点一下？谢谢了
赞一下 回复此楼
QQ：584473782欢迎访问http://leorunfast.wordpress.com
5楼2010-06-30 21:18:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

guojialin
wjqhp(金币+1): 2010-07-01 05:54:34
6楼2010-06-30 22:22:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wjqhp

木虫 (正式写手)

问题已解决

★ ★
cenwanglai(金币+2):谢谢分享.希望求助贴成功后,都能总结分享. 2010-07-01 08:05:41
感谢各位的讨论，金币持续发放中。

解决方案如下：

1. 重新认识由Forcite analysis 得到的radial distribution function
本以为得到的RDF需要使用(N/V)*g(r)*4Pi*r^2*dr进行积分，一直没有得到正确结果。
实际上发现g(r)*4Pi*r^2*dr对（0，Rmax)积分结果为1. 这个定义在我看来，是MS的错误，只要能解决问题就行，我也不议论这些了。
2. 利用N*g(r)*4Pi*r^2*dr对.std数据表中所有数据加和，采用bin size=dr；就得到径向分布各层的配位数；
3. 壳层的定义
壳层的定义具有一定的主观性，要根据自己的需要来定义“哪些相邻的配位数是否属于同一层“。
赞一下(4人) 回复此楼

» 本帖已获得的红花（最新10朵）

星空0206
QQ：584473782欢迎访问http://leorunfast.wordpress.com
7楼2010-07-01 06:14:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jwucn

至尊木虫 (文坛精英)
学习了。
回复此楼
8楼2010-07-01 08:02:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wanna_get

新虫 (初入文坛)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
7楼: Originally posted by wjqhp at 2010-07-01 06:14:05
感谢各位的讨论，金币持续发放中。

解决方案如下：

1. 重新认识由Forcite analysis 得到的radial distribution function
本以为得到的RDF需要使用(N/V)*g(r)*4Pi*r^2*dr进行积分，一直没有得到正确结果。
实 ...

您好，在ms中得出r和g（r）后，计算配位数这部分看的不是很明白，其中数据加和及后面的bin size指的是什么呢？望能指点一二
赞一下 回复此楼
9楼2018-05-27 20:33:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

星空0206

铁虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
送红花一朵
引用回帖:
7楼: Originally posted by wjqhp at 2010-07-01 06:14:05
感谢各位的讨论，金币持续发放中。

解决方案如下：

1. 重新认识由Forcite analysis 得到的radial distribution function
本以为得到的RDF需要使用(N/V)*g(r)*4Pi*r^2*dr进行积分，一直没有得到正确结果。
实 ...

请问bin size=dr 是什么意思？怎么操作。感谢。
赞一下 回复此楼
10楼2020-01-07 09:53:48
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 wjqhp 的主题更新
101/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 一志愿苏州大学材料工程（085601）专硕有科研经历三项国奖两个实用型专利一项省级立项 +10 大火山小火山 2026-04-05 10/500 2026-04-05 19:58 by 小蜗牛小蜗牛
[考研] 材料专硕(0856) 339分求调剂 +10 哈哈哈鹅哈哈哈 2026-04-04 10/500 2026-04-05 18:51 by 蓝云思雨
[考研] 化学调剂 +14 艾志恒 2026-04-03 15/750 2026-04-05 18:06 by 猪会飞
[考研] 一志愿南航，数一英一学硕317求调剂！！ +5 Acaciad 2026-04-04 5/250 2026-04-05 12:31 by 搏击518
[考研] 材料化工306分找合适调剂 +14 沧海轻舟e 2026-04-04 14/700 2026-04-05 09:53 by 朱云虎202
[考研] 353求调剂 +10 MayUxw1 2026-04-03 10/500 2026-04-05 09:23 by 无际的草原
[考研] 一志愿北京2，材料与化工308求调剂 +10 熊二想上岸 2026-04-04 10/500 2026-04-05 05:20 by houyaoxu
[考博] 申博 +7 IQwQl 2026-04-04 7/350 2026-04-04 23:32 by mumin1990
[考研] 338求调剂 +7 晟功? 2026-04-03 7/350 2026-04-04 20:37 by 蓝云思雨
[考研] 342求调剂 +3 Liang7111 2026-04-04 5/250 2026-04-04 19:47 by dongzh2009
[考研] 266求调剂 +8 学员97LZgn 2026-04-03 8/400 2026-04-04 09:02 by 20021109
[考研] 311求调剂 +11 勇敢的小吴 2026-04-02 11/550 2026-04-03 21:46 by qlm5820
[考研] 数二英二348求调剂 +4 hxdzj1 2026-04-03 5/250 2026-04-03 21:25 by zhq0425
[考研] 312 化工或制药调剂 +8 小小墨123 2026-04-02 9/450 2026-04-03 09:12 by zhouxiaoyu
[考研] 085600，320分求调剂 +6 大馋小子 2026-04-02 6/300 2026-04-02 21:54 by dongzh2009
[考研] 一志愿北京科技材料科学与工程288分，求调剂 +14 是辰啊 2026-04-02 14/700 2026-04-02 21:10 by dongzh2009
[考研] 材料专硕322分 +11 哈哈哈吼吼吼哈 2026-04-01 11/550 2026-04-02 10:52 by lnilvy
[考研] 0710生物学，325求调剂 +3 mkkkkkl 2026-04-01 3/150 2026-04-02 09:48 by Jaylen.
[考研] 物理学调剂 +4 小羊36 2026-03-30 4/200 2026-03-31 16:16 by lishahe
[考研] 哈尔滨工业大学材料与化工专硕378求调剂 +3 塔比乌斯 2026-03-30 3/150 2026-03-30 22:55 by 无际的草原
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭