24小时热门版块排行榜    

查看: 3886  |  回复: 12

计算化学新人

铜虫 (小有名气)

[求助] openmpi编译求助 已有2人参与

CXX      otfaux.o
/usr/include/c++/4.8.2/ext/atomicity.h(49): error: identifier "__ATOMIC_ACQ_REL"                                                                              is undefined
    { return __atomic_fetch_add(__mem, __val, __ATOMIC_ACQ_REL); }
                                              ^

/usr/include/c++/4.8.2/ext/atomicity.h(49): error: identifier "__atomic_fetch_ad                                                                             d" is undefined
    { return __atomic_fetch_add(__mem, __val, __ATOMIC_ACQ_REL); }
             ^

/usr/include/c++/4.8.2/ext/atomicity.h(53): error: identifier "__ATOMIC_ACQ_REL"                                                                              is undefined
    { __atomic_fetch_add(__mem, __val, __ATOMIC_ACQ_REL); }
                                       ^

/usr/include/c++/4.8.2/ext/atomicity.h(53): error: identifier "__atomic_fetch_ad                                                                             d" is undefined
    { __atomic_fetch_add(__mem, __val, __ATOMIC_ACQ_REL); }
      ^

compilation aborted for otfaux.cpp (code 2)
make[9]: *** [otfaux.o] 错误 2
make[9]: 离开目录“/home/admin/openmpi-1.8.3/ompi/contrib/vt/vt/extlib/otf/tools/                                                                             otfaux”
make[8]: *** [all-recursive] 错误 1
make[8]: 离开目录“/home/admin/openmpi-1.8.3/ompi/contrib/vt/vt/extlib/otf/tools”
make[7]: *** [all-recursive] 错误 1
make[7]: 离开目录“/home/admin/openmpi-1.8.3/ompi/contrib/vt/vt/extlib/otf”
make[6]: *** [all] 错误 2
make[6]: 离开目录“/home/admin/openmpi-1.8.3/ompi/contrib/vt/vt/extlib/otf”
make[5]: *** [all-recursive] 错误 1
make[5]: 离开目录“/home/admin/openmpi-1.8.3/ompi/contrib/vt/vt/extlib”
make[4]: *** [all-recursive] 错误 1
make[4]: 离开目录“/home/admin/openmpi-1.8.3/ompi/contrib/vt/vt”
make[3]: *** [all] 错误 2
make[3]: 离开目录“/home/admin/openmpi-1.8.3/ompi/contrib/vt/vt”
make[2]: *** [all-recursive] 错误 1
make[2]: 离开目录“/home/admin/openmpi-1.8.3/ompi/contrib/vt”
make[1]: *** [all-recursive] 错误 1
make[1]: 离开目录“/home/admin/openmpi-1.8.3/ompi”
make: *** [all-recursive] 错误 1

在此之前用了./configure CC=icc CXX=icpc F77=ifort FC=ifort
然后用了make,最后出来以上错误
不知道应该怎么去解决,求大神们助攻!
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

KalaShayminS

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
ljw4010: 金币+1, 谢谢交流! 2015-04-08 22:42:11
intel编译器版本和gcc编译器版本分别是多少?疑似是两个版本差了太多导致的不兼容。
2楼2015-04-08 20:49:35
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

白菜胡萝卜

木虫 (正式写手)


【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
liliangfang: 金币+1, 谢谢交流 2015-04-09 07:50:34
用GCC 和gfortran编译就不出错。至于为啥我现在也没搞清楚。另外,楼主是root安装的么?感觉也有可能是权限问题
3楼2015-04-09 04:24:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

计算化学新人

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by KalaShayminS at 2015-04-08 20:49:35
intel编译器版本和gcc编译器版本分别是多少?疑似是两个版本差了太多导致的不兼容。

你好,我的gcc是4.8.2,icc是2011,请问这俩不兼容吗?如果是,应该怎么办?
4楼2015-04-09 08:38:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

计算化学新人

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 白菜胡萝卜 at 2015-04-09 04:24:58
用GCC 和gfortran编译就不出错。至于为啥我现在也没搞清楚。另外,楼主是root安装的么?感觉也有可能是权限问题

用的是root,网上都是icc和ifort编译的,我也不太懂,只能跟着网上的教程走啊
5楼2015-04-09 08:39:35
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

KalaShayminS

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
5楼: Originally posted by 计算化学新人 at 2015-04-09 08:39:35
用的是root,网上都是icc和ifort编译的,我也不太懂,只能跟着网上的教程走啊...

icc版本太低,换13以上即可
6楼2015-04-09 13:12:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

计算化学新人

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
6楼: Originally posted by KalaShayminS at 2015-04-09 13:12:11
icc版本太低,换13以上即可...

但是我能拿到序列号的只有11版,现在intel官网没有非商业版了啊
我下过一个学生版,但是只有c++,没有Fortran
请问怎么办?
7楼2015-04-09 17:23:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

KalaShayminS

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
7楼: Originally posted by 计算化学新人 at 2015-04-09 17:23:42
但是我能拿到序列号的只有11版,现在intel官网没有非商业版了啊
我下过一个学生版,但是只有c++,没有Fortran
请问怎么办?...

或者用低版本的gcc,4.7以下即可
8楼2015-04-09 17:42:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

计算化学新人

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
8楼: Originally posted by KalaShayminS at 2015-04-09 17:42:26
或者用低版本的gcc,4.7以下即可...

意思是我要重新装gcc是吧,需要先把原来那个删掉吗?
9楼2015-04-09 19:19:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

KalaShayminS

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
9楼: Originally posted by 计算化学新人 at 2015-04-09 19:19:11
意思是我要重新装gcc是吧,需要先把原来那个删掉吗?...

可以不用,编译时指定编译器即可。不过我觉得还是直接用gcc/gfortran编译而不是intel,或者想办法下个新版intel编译器比较省事。
10楼2015-04-09 20:05:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 计算化学新人 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 2019年青年基金涵评意见,大家看看几个A,几个B? +4 Tide man 2026-08-11 4/200 2026-08-12 00:39 by liuqidi
[基金申请] 奇怪,两个人的filecode固定段从头到尾一模一样 +7 布布和一二 2026-08-10 9/450 2026-08-11 22:12 by 医学老男孩
[基金申请] 帮忙看看fileCode +7 wwncly 2026-08-10 13/650 2026-08-11 19:36 by 冰心玉壶晴
[硕博家园] 读博的好处 +3 lnee 2026-08-11 3/150 2026-08-11 18:10 by 希望我好好的
[论文投稿] 职称评审,求友友推荐见刊最快的期刊 +3 工厂打螺丝 2026-08-08 3/150 2026-08-11 13:42 by 会议编辑
[基金申请] filecode +9 documentary 2026-08-10 9/450 2026-08-11 10:08 by wk7465
[基金申请] 关于代码变化问题,想知道的进来 +17 且听虎啸 2026-08-07 24/1200 2026-08-10 18:35 by zhangduo2008
[基金申请] 关于Filecode分析方法 +3 majunge000 2026-08-10 3/150 2026-08-10 15:46 by lch2012
[基金申请] 好奇怪的filecode +4 布布和一二 2026-08-08 5/250 2026-08-10 14:20 by 冰心玉壶晴
[基金申请] 2026国自然放榜时间 +9 布布和一二 2026-08-08 9/450 2026-08-10 11:22 by xxxx2020
[基金申请] 这样的filecode谁见过 +11 布布和一二 2026-08-08 22/1100 2026-08-10 11:10 by wmfsnow
[基金申请] filecode与中标关系的预测 +5 布布和一二 2026-08-07 5/250 2026-08-09 16:15 by 袁向阳007
[基金申请] fileCode有新解读? +10 Tide man 2026-08-08 18/900 2026-08-09 12:55 by 仁砚薪传
[基金申请] 关于filecode,很负责任的告诉大家 +6 爱看书的可乐 2026-08-08 7/350 2026-08-08 22:13 by a_niu
[基金申请] 关于豆爷回答的JTJC与%2F数量 +5 yang182083 2026-08-06 7/350 2026-08-08 18:29 by zhanghaozhu
[基金申请] 国基金的申报应该改成非等额制,评价高的钱多评价低的钱少,但是增加资助率 +7 a089 2026-08-07 7/350 2026-08-08 18:05 by gltch
[基金申请] 关于filecode +4 布布和一二 2026-08-07 7/350 2026-08-07 22:55 by zhanghaozhu
[基金申请] 化学口download_prp&fileCode的固定段好像这几天一直没变,有变的大神么? +3 Tide man 2026-08-07 4/200 2026-08-07 22:39 by Tide man
[基金申请] 大家散了吧,后缀研究没有意义,别浪费时间了,过好目前的每一天,不要焦虑 +5 Tide man 2026-08-06 7/350 2026-08-07 13:11 by 医学老男孩
[基金申请] 求各位大神看下 100+6 hpkpkpkp 2026-08-05 33/1650 2026-08-06 14:49 by zhiyanjiang
信息提示
请填处理意见