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计算化学新人

铜虫 (小有名气)

[求助] openmpi编译求助已有2人参与

CXX      otfaux.o
/usr/include/c++/4.8.2/ext/atomicity.h(49): error: identifier "__ATOMIC_ACQ_REL"                                                                              is undefined
    { return __atomic_fetch_add(__mem, __val, __ATOMIC_ACQ_REL); }
                                              ^

/usr/include/c++/4.8.2/ext/atomicity.h(49): error: identifier "__atomic_fetch_ad                                                                             d" is undefined
    { return __atomic_fetch_add(__mem, __val, __ATOMIC_ACQ_REL); }
             ^

/usr/include/c++/4.8.2/ext/atomicity.h(53): error: identifier "__ATOMIC_ACQ_REL"                                                                              is undefined
    { __atomic_fetch_add(__mem, __val, __ATOMIC_ACQ_REL); }
                                       ^

/usr/include/c++/4.8.2/ext/atomicity.h(53): error: identifier "__atomic_fetch_ad                                                                             d" is undefined
    { __atomic_fetch_add(__mem, __val, __ATOMIC_ACQ_REL); }
      ^

compilation aborted for otfaux.cpp (code 2)
make[9]: *** [otfaux.o] 错误 2
make[9]: 离开目录“/home/admin/openmpi-1.8.3/ompi/contrib/vt/vt/extlib/otf/tools/                                                                             otfaux”
make[8]: *** [all-recursive] 错误 1
make[8]: 离开目录“/home/admin/openmpi-1.8.3/ompi/contrib/vt/vt/extlib/otf/tools”
make[7]: *** [all-recursive] 错误 1
make[7]: 离开目录“/home/admin/openmpi-1.8.3/ompi/contrib/vt/vt/extlib/otf”
make[6]: *** [all] 错误 2
make[6]: 离开目录“/home/admin/openmpi-1.8.3/ompi/contrib/vt/vt/extlib/otf”
make[5]: *** [all-recursive] 错误 1
make[5]: 离开目录“/home/admin/openmpi-1.8.3/ompi/contrib/vt/vt/extlib”
make[4]: *** [all-recursive] 错误 1
make[4]: 离开目录“/home/admin/openmpi-1.8.3/ompi/contrib/vt/vt”
make[3]: *** [all] 错误 2
make[3]: 离开目录“/home/admin/openmpi-1.8.3/ompi/contrib/vt/vt”
make[2]: *** [all-recursive] 错误 1
make[2]: 离开目录“/home/admin/openmpi-1.8.3/ompi/contrib/vt”
make[1]: *** [all-recursive] 错误 1
make[1]: 离开目录“/home/admin/openmpi-1.8.3/ompi”
make: *** [all-recursive] 错误 1

在此之前用了./configure CC=icc CXX=icpc F77=ifort FC=ifort
然后用了make,最后出来以上错误
不知道应该怎么去解决,求大神们助攻!
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KalaShayminS

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
ljw4010: 金币+1, 谢谢交流! 2015-04-08 22:42:11
intel编译器版本和gcc编译器版本分别是多少?疑似是两个版本差了太多导致的不兼容。
2楼2015-04-08 20:49:35
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白菜胡萝卜

木虫 (正式写手)


【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
liliangfang: 金币+1, 谢谢交流 2015-04-09 07:50:34
用GCC 和gfortran编译就不出错。至于为啥我现在也没搞清楚。另外,楼主是root安装的么?感觉也有可能是权限问题
3楼2015-04-09 04:24:58
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计算化学新人

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by KalaShayminS at 2015-04-08 20:49:35
intel编译器版本和gcc编译器版本分别是多少?疑似是两个版本差了太多导致的不兼容。

你好,我的gcc是4.8.2,icc是2011,请问这俩不兼容吗?如果是,应该怎么办?
4楼2015-04-09 08:38:44
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计算化学新人

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 白菜胡萝卜 at 2015-04-09 04:24:58
用GCC 和gfortran编译就不出错。至于为啥我现在也没搞清楚。另外,楼主是root安装的么?感觉也有可能是权限问题

用的是root,网上都是icc和ifort编译的,我也不太懂,只能跟着网上的教程走啊
5楼2015-04-09 08:39:35
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KalaShayminS

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
5楼: Originally posted by 计算化学新人 at 2015-04-09 08:39:35
用的是root,网上都是icc和ifort编译的,我也不太懂,只能跟着网上的教程走啊...

icc版本太低,换13以上即可
6楼2015-04-09 13:12:11
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计算化学新人

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
6楼: Originally posted by KalaShayminS at 2015-04-09 13:12:11
icc版本太低,换13以上即可...

但是我能拿到序列号的只有11版,现在intel官网没有非商业版了啊
我下过一个学生版,但是只有c++,没有Fortran
请问怎么办?
7楼2015-04-09 17:23:42
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KalaShayminS

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
7楼: Originally posted by 计算化学新人 at 2015-04-09 17:23:42
但是我能拿到序列号的只有11版,现在intel官网没有非商业版了啊
我下过一个学生版,但是只有c++,没有Fortran
请问怎么办?...

或者用低版本的gcc,4.7以下即可
8楼2015-04-09 17:42:26
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计算化学新人

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
8楼: Originally posted by KalaShayminS at 2015-04-09 17:42:26
或者用低版本的gcc,4.7以下即可...

意思是我要重新装gcc是吧,需要先把原来那个删掉吗?
9楼2015-04-09 19:19:11
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KalaShayminS

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
9楼: Originally posted by 计算化学新人 at 2015-04-09 19:19:11
意思是我要重新装gcc是吧,需要先把原来那个删掉吗?...

可以不用,编译时指定编译器即可。不过我觉得还是直接用gcc/gfortran编译而不是intel,或者想办法下个新版intel编译器比较省事。
10楼2015-04-09 20:05:26
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