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板桥霜木虫 (正式写手)
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[求助]
求助--Openmpi-1.8集群编译问题 已有2人参与
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各位大侠,本人纯属菜鸟,最近出于好奇,爱好,兴趣。。。。。搞了几台台古董,想自己搭建集群,怎奈基础不牢,从开始到现在快两个周了,还没有成功,废话不多说,上问题,忘各位不吝赐教。 硬件环境:1台浪潮服务器:2个CPU,两核,Intel Xeon 2.4GHz. 2台并行机,1个CPU,Pentium D 3.4GHz,1000M交换机。 软件:redhat linux 6.2,Intel l_fcompcxe_2013_sp1.2.144 & l_ccompcxe_3013_sp1.2.144, Openmpi-1.8,目标是并行编译安装vasp5.2,实现并行运算。 目前进行到单机并行编译VASP,运算没有问题,但是无法实现集群并行运算。我感觉问题出现在Openmpi上,经过我自己的测试,编译Openmpi用以下指令: ./configure --prefix=/usr/local/openmpi-1.8 FC=/opt/intel/bin/ifort CC=/opt/intel/bin/icc CXX=/opt/intel/bin/cipc make make install 后测试运行hello_c 结果: hello, world, I am 0 of 2,..... hello, world, I am 1 of 2,.... 如果修改openmpi-default-hostfile添加各节点; LAB-P1 slots=1 LAB-P2 slots=2 运行测试 mpirun hello_c 得到结果如下: bash: orted: command not found bash: orted: command not found 请问各位大侠,是我的openmpi 没有编译对吗?如果是,问题出在哪?我该怎么做?如果不是又该怎么处理呢? 谢谢! |
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【答案】应助回帖
感谢参与,应助指数 +1
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问一句,你的两台机器做了共享NFS服务否,还有吉他相关集群设置问题。可以参考一下我以前做搭建做的一些笔记: http://vasp1860.blog.edu.cn/home ... g&id=159741 |
2楼2014-04-27 20:48:58
板桥霜
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3楼2014-04-27 21:49:37
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7楼2014-04-27 22:26:12
chuanghua304
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8楼2014-04-27 22:31:17
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9楼2014-04-27 22:48:31
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