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板桥霜

木虫 (正式写手)

[求助] 求助--Openmpi-1.8集群编译问题 已有2人参与

各位大侠,本人纯属菜鸟,最近出于好奇,爱好,兴趣。。。。。搞了几台台古董,想自己搭建集群,怎奈基础不牢,从开始到现在快两个周了,还没有成功,废话不多说,上问题,忘各位不吝赐教。
硬件环境:1台浪潮服务器:2个CPU,两核,Intel Xeon 2.4GHz. 2台并行机,1个CPU,Pentium D 3.4GHz,1000M交换机。
软件:redhat linux 6.2,Intel l_fcompcxe_2013_sp1.2.144 & l_ccompcxe_3013_sp1.2.144, Openmpi-1.8,目标是并行编译安装vasp5.2,实现并行运算。
目前进行到单机并行编译VASP,运算没有问题,但是无法实现集群并行运算。我感觉问题出现在Openmpi上,经过我自己的测试,编译Openmpi用以下指令:
./configure --prefix=/usr/local/openmpi-1.8 FC=/opt/intel/bin/ifort CC=/opt/intel/bin/icc CXX=/opt/intel/bin/cipc
make
make install
后测试运行hello_c
结果:
hello, world, I am 0 of 2,.....
hello, world, I am 1 of 2,....
如果修改openmpi-default-hostfile添加各节点;
LAB-P1 slots=1
LAB-P2 slots=2
运行测试
mpirun hello_c
得到结果如下:
bash: orted: command not found
bash: orted: command not found
请问各位大侠,是我的openmpi 没有编译对吗?如果是,问题出在哪?我该怎么做?如果不是又该怎么处理呢?
谢谢!
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mywai520

铁杆木虫 (著名写手)


【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
问一句,你的两台机器做了共享NFS服务否,还有吉他相关集群设置问题。可以参考一下我以前做搭建做的一些笔记:
http://vasp1860.blog.edu.cn/home ... g&id=159741
2楼2014-04-27 20:48:58
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板桥霜

木虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by mywai520 at 2014-04-27 20:48:58
问一句,你的两台机器做了共享NFS服务否,还有吉他相关集群设置问题。可以参考一下我以前做搭建做的一些笔记:
http://vasp1860.blog.edu.cn/home.php?mod=space&uid=1556291&do=blog&id=159741...

作了共享了,我先学习下

[ 发自小木虫客户端 ]
3楼2014-04-27 21:49:37
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板桥霜

木虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by mywai520 at 2014-04-27 20:48:58
问一句,你的两台机器做了共享NFS服务否,还有吉他相关集群设置问题。可以参考一下我以前做搭建做的一些笔记:
http://vasp1860.blog.edu.cn/home.php?mod=space&uid=1556291&do=blog&id=159741...

大侠,你是用的mpi﹉

[ 发自小木虫客户端 ]
4楼2014-04-27 21:55:20
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mywai520

铁杆木虫 (著名写手)


【答案】应助回帖

不用mpi怎么并行,不过那已经是很多年前做的集群。
若是你现在要做集群,建议你用rocks,这样可以省很多事情。
5楼2014-04-27 21:59:38
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板桥霜

木虫 (正式写手)

引用回帖:
5楼: Originally posted by mywai520 at 2014-04-27 21:59:38
不用mpi怎么并行,不过那已经是很多年前做的集群。
若是你现在要做集群,建议你用rocks,这样可以省很多事情。

mpi和openmpi不一样吧 大侠多指教

[ 发自小木虫客户端 ]
6楼2014-04-27 22:18:11
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mywai520

铁杆木虫 (著名写手)


引用回帖:
6楼: Originally posted by 板桥霜 at 2014-04-27 22:18:11
mpi和openmpi不一样吧 大侠多指教
...

mpi并行软件有几种:mpich2 mpich  openmpi  intel-mpi  Hp-mpi
但是基本都是一样,只是开发者不同而已。现在多用openmpi,因为是开源的。但是跟mipch或者mpich2区别不大,其实根本就没有区别。都是mpi,用来做并行计算的代码。

你现在的问题,不是集群装个MPI就能并行了。需要设置磁盘共享,网络共享,数据同步等相关服务。装mpi只是给你提供一个并行服务,并不能在没有前面相关支持下就能两台不相干的机器就能并行。
7楼2014-04-27 22:26:12
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chuanghua304

禁虫 (职业作家)

本帖内容被屏蔽

8楼2014-04-27 22:31:17
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mywai520

铁杆木虫 (著名写手)


集群不是装一个openmpi就是集群,就能并行!!!!!
9楼2014-04-27 22:48:31
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板桥霜

木虫 (正式写手)

引用回帖:
8楼: Originally posted by chuanghua304 at 2014-04-27 22:31:17
./configure CC=icc CXX=icpc F77=ifort FC=ifort --prefix=/opt/openmpi --enable-static  用这个编译openmpi

生成动态和静态库有何区别?

[ 发自小木虫客户端 ]
10楼2014-04-27 23:04:28
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